Two strings $x$ and $y$ over $\Sigma \cup \Pi$ of equal length are said to \emph{parameterized match} (\emph{p-match}) if there is a renaming bijection $f:\Sigma \cup \Pi \rightarrow \Sigma \cup \Pi$ that is identity on $\Sigma$ and transforms $x$ to $y$ (or vice versa). The \emph{p-matching} problem is to look for substrings in a text that p-match a given pattern. In this paper, we propose \emph{parameterized suffix automata} (\emph{p-suffix automata}) and \emph{parameterized directed acyclic word graphs} (\emph{PDAWGs}) which are the p-matching versions of suffix automata and DAWGs. While suffix automata and DAWGs are equivalent for standard strings, we show that p-suffix automata can have $\Theta(n^2)$ nodes and edges but PDAWGs have only $O(n)$ nodes and edges, where $n$ is the length of an input string. We also give an $O(n |\Pi| \log (|\Pi| + |\Sigma|))$-time $O(n)$-space algorithm that builds the PDAWG in a left-to-right online manner. As a byproduct, it is shown that the \emph{parameterized suffix tree} for the reversed string can also be built in the same time and space, in a right-to-left online manner. This duality also leads us to two further efficient algorithms for p-matching: Given the parameterized suffix tree for the reversal of the input string $T$, one can build the PDAWG of $T$ in $O(n)$ time in an offline manner; One can perform \emph{bidirectional} p-matching in $O(m \log (|\Pi|+|\Sigma|) + \mathit{occ})$ time using $O(n)$ space, where $m$ denotes the pattern length and $\mathit{occ}$ is the number of pattern occurrences in the text $T$.


翻译:双字符串 $x美元和美元 $Sigma\ cup\ pi 美元以上 $(或反之) 。 \ emph{p- pmarch} 问题在于在 p- committed 匹配的文本中查找子字符串 $( emph{ patch} ) (=Sigma\ pi\ pi) 美元以上; 如果有重命名双字串 $f:\ sigma\ pi\ pifrma\ pi 美元以下的字符串 :\\ sigma 美元 美元以上; 如果有重命名的双字符串 $( lima} 美元以上), 将 美元转换成 $( 或反之) 美元 。 iemph=phr======= 美元 美元, 问题在于在 pxxxx 的文本中查找 =xxxxxxxxxxxxxx 数 美元 。

0
下载
关闭预览

相关内容

不可错过!《机器学习100讲》课程,UBC Mark Schmidt讲授
专知会员服务
73+阅读 · 2022年6月28日
【如何做研究】How to research ,22页ppt
专知会员服务
108+阅读 · 2021年4月17日
专知会员服务
17+阅读 · 2020年9月6日
Linux导论,Introduction to Linux,96页ppt
专知会员服务
78+阅读 · 2020年7月26日
专知会员服务
161+阅读 · 2020年1月16日
《DeepGCNs: Making GCNs Go as Deep as CNNs》
专知会员服务
30+阅读 · 2019年10月17日
机器学习入门的经验与建议
专知会员服务
92+阅读 · 2019年10月10日
征稿 | International Joint Conference on Knowledge Graphs (IJCKG)
开放知识图谱
2+阅读 · 2022年5月20日
VCIP 2022 Call for Special Session Proposals
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年4月1日
详解PyTorch中的ModuleList和Sequential
极市平台
0+阅读 · 2022年1月28日
【ICIG2021】Latest News & Announcements of the Workshop
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年12月20日
【ICIG2021】Check out the hot new trailer of ICIG2021 Symposium5
中国图象图形学学会CSIG
1+阅读 · 2021年11月11日
【ICIG2021】Check out the hot new trailer of ICIG2021 Symposium1
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年11月3日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
26+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
28+阅读 · 2019年5月18日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
17+阅读 · 2018年12月24日
【论文】图上的表示学习综述
机器学习研究会
14+阅读 · 2017年9月24日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2010年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
Directional Graph Networks
Arxiv
27+阅读 · 2020年12月10日
VIP会员
相关VIP内容
不可错过!《机器学习100讲》课程,UBC Mark Schmidt讲授
专知会员服务
73+阅读 · 2022年6月28日
【如何做研究】How to research ,22页ppt
专知会员服务
108+阅读 · 2021年4月17日
专知会员服务
17+阅读 · 2020年9月6日
Linux导论,Introduction to Linux,96页ppt
专知会员服务
78+阅读 · 2020年7月26日
专知会员服务
161+阅读 · 2020年1月16日
《DeepGCNs: Making GCNs Go as Deep as CNNs》
专知会员服务
30+阅读 · 2019年10月17日
机器学习入门的经验与建议
专知会员服务
92+阅读 · 2019年10月10日
相关资讯
征稿 | International Joint Conference on Knowledge Graphs (IJCKG)
开放知识图谱
2+阅读 · 2022年5月20日
VCIP 2022 Call for Special Session Proposals
CCF多媒体专委会
1+阅读 · 2022年4月1日
详解PyTorch中的ModuleList和Sequential
极市平台
0+阅读 · 2022年1月28日
【ICIG2021】Latest News & Announcements of the Workshop
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年12月20日
【ICIG2021】Check out the hot new trailer of ICIG2021 Symposium5
中国图象图形学学会CSIG
1+阅读 · 2021年11月11日
【ICIG2021】Check out the hot new trailer of ICIG2021 Symposium1
中国图象图形学学会CSIG
0+阅读 · 2021年11月3日
Hierarchically Structured Meta-learning
CreateAMind
26+阅读 · 2019年5月22日
Transferring Knowledge across Learning Processes
CreateAMind
28+阅读 · 2019年5月18日
A Technical Overview of AI & ML in 2018 & Trends for 2019
待字闺中
17+阅读 · 2018年12月24日
【论文】图上的表示学习综述
机器学习研究会
14+阅读 · 2017年9月24日
相关基金
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2015年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2014年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2013年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2012年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2011年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2010年12月31日
国家自然科学基金
0+阅读 · 2009年12月31日
Top
微信扫码咨询专知VIP会员