Medical data collected for making a diagnostic decision are typically multi-modal and provide complementary perspectives of a subject. A computer-aided diagnosis system welcomes multi-modal inputs; however, how to effectively fuse such multi-modal data is a challenging task and attracts a lot of attention in the medical research field. In this paper, we propose a transformer-based framework, called Alifuse, for aligning and fusing multi-modal medical data. Specifically, we convert images and unstructured and structured texts into vision and language tokens, and use intramodal and intermodal attention mechanisms to learn holistic representations of all imaging and non-imaging data for classification. We apply Alifuse to classify Alzheimer's disease and obtain state-of-the-art performance on five public datasets, by outperforming eight baselines. The source code will be available online later.


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