基于转录组分析探究普通野生稻北缘种群对低温的适应

项目名称： 基于转录组分析探究普通野生稻北缘种群对低温的适应

项目编号： No.31400327

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 周雯

作者单位： 复旦大学

项目金额： 23万元

中文摘要： 植物对低温环境的适应一直是进化生态学研究的核心问题之一，对于揭示植物对全球气候变化的响应机制和耐低温资源的挖掘具有重要的科学意义。普通野生稻是事关国家粮食安全的战略性资源，广泛分布于热带和亚热带地区，沿着纬度梯度（主要是温度梯度）呈现出显著的渐变群式样，形成了丰富的表型和遗传变异。前期研究发现，普通野生稻北缘种群明显表现出对低温的适应性，但其适应低温的机制尚缺乏了解。本项目选取北缘种群与低纬度种群进行对比研究，聚焦于植物生活史中对环境变化最为敏感的萌发和立苗阶段，在转录组水平上分析种子和幼苗在不同温度梯度的差异表达基因，结合表型观测、生理检测，以及积温模型估算与生长试验，来阐明普通野生稻北缘种群对低温的适应模式及生态与分子机制。本研究的完成，既能促进对植物响应气候变化机制的认识，加深对植物地理分化机制的了解，又能为水稻耐低温基因资源的挖掘与利用提供数据支持和理论支撑。

中文关键词： 普通野生稻；种子萌发；低温适应；RNA-seq；基因共表达网络

英文摘要： The mechanism underlying adaptation of plants to low temperature is one of the core issues of evolutionary biology and ecology, which playing great role in revealing plants response to global climate change and in exploring the genetic resources of plant

英文关键词： Oryza rufipogon；seed germination；cold adaptation；RNA-seq；gene co-expression network