基于转录组学的杂色鲍早期发育关键阶段基因调控网络研究

项目名称： 基于转录组学的杂色鲍早期发育关键阶段基因调控网络研究

项目编号： No.40976093

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 天文学、地球科学

项目作者： 陈军

作者单位： 厦门大学

项目金额： 49万元

中文摘要： 贝类早期发育尤其是附着变态的基因调控网络的阐明对发育生物学、细胞生物学和进化理论有着重要意义，同时在贝类水产养殖上有重要的应用价值。但是贝类早期发育相关基因序列的匮乏和单基因研究手段的低效率限制了这个问题的解答。转录组学方法恰好可以弥补这两点缺陷，为阐明早期发育机理提供了可能。本项目首先通过基于测序的转录组学方法，构建大容量的、覆盖杂色鲍早期发育阶段的基因序列数据库，这解决了基因序列匮乏的障碍；然后通过对关键阶段高深度的基因表达谱的聚类分析，结合全胚原位杂交等实验验证的方法可靠地得到参与各个生物学过程的基因聚类，这就突破了单基因研究手段低效的限制，实现高通量地基因功能解释；在这基础上利用DNaseI印迹和体外转录等实验方法确定关键基因的上游/下游关联基因，建立聚类内部或聚类之间的联系，最终构建杂色鲍早期发育尤其是附着变态阶段的基因调控网络模型。

中文关键词： 附着变态；转录组学；基因表达聚类；基因调控网络；杂色鲍

英文摘要：

英文关键词： settlement and metamorphosis；transcriptomics；gene expression profile；gene regulatory network；Haliotis diversicolor