项目名称: 小波分析在定量蛋白质组学中的几个应用
项目编号: No.10971189
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2010
项目学科: 数理科学和化学
项目作者: 莫群
作者单位: 浙江大学
项目金额: 25万元
中文摘要: 定量蛋白质组学可以动态、整体地研究肿瘤等复杂、多因素的重大疾病。它被认为是本世纪六大前沿课题之一。小波基具有良好的时-频局部性。用它对海量质谱数据做像信号去噪之类的处理非常有效。本项目研究小波分析在定量蛋白质组学的三个应用:1.用小波分析改善液质联用(LC-MS)和液相色谱-串联质谱联用(LC-MS-MS)的数据分析。2.将小波滤波方法引入蛋白质组学中的ASAPRatio程序,来取得更精确的结果。3.开发流水线软件系列,用蛋白质组学数据库来研究蛋白异形体和蛋白翻译后修饰(PTMs)。本项目的难点和关键问题有:1. 提高质谱数据定量分析软件的精确性。2.利用质谱数据寻找由可变剪切形成的新的蛋白异形体。3.利用质谱数据寻找蛋白质翻译后修饰(PTMs)。本项目的成功实施,将产生更精确以及更有效地利用高通量质谱数据的算法和软件。对有效地利用差异蛋白质组学找出肿瘤标记物和药物靶点产生积极影响。
中文关键词: 小波分析;小波域图像去噪;液质联用(LC-MS);定量蛋白质组学;质谱分析
英文摘要:
英文关键词: wavelet analysis;image de-noising;liquid spectrometry(LC-MS);quantitative proteomics;mass spectrometry(MS) analysis