项目名称: 表观遗传修饰参与UV-A特异诱导芜菁花青素合成机制研究
项目编号: No.31401907
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2014
项目学科: 农业科学
项目作者: 王宇
作者单位: 东北林业大学
项目金额: 26万元
中文摘要: 紫外线照射可以导致部分植物积累花青素,这是一种自我调节机制。研究发现依光型花青素合成的津田芜菁只受UV-A及UV-B与蓝光复合光诱导。转录组学研究结果表明UV-A特异诱导表达基因群的启动子区中并不含有相同的顺式作用元件,同时部分津田芜菁自交子代个体中存在对UV-A敏感程度不同的现象,这些均表明存在非孟德尔遗传机制的调控。本研究为鉴定UV-A特异诱导芜菁花青素合成过程中可能存在的表观遗传修饰,利用全基因组重亚硫酸盐测序及ChIP-seq的方法对UV-A照射前后津田芜菁全基因组内DNA甲基化修饰程度不同及特异发生组蛋白修饰的位点进行分离。通过生物信息学方法对这些位点与UV-A特异诱导基因群相互比较筛选可能参与该过程的表观遗传学修饰位点,并利用UV-A敏感程度不同的芜菁进行验证。本项目旨在发现UV-A诱导芜菁花青素合成过程中的表观遗传修饰调控规律,为揭示依光型花青素合成分子机制提供新的视角。
中文关键词: 转座子;MITE;DNA甲基化;基因表达;花青素合成
英文摘要: UV radiation from the sun can induce anthocyanin accumulation, which is an adaptive adjustment mechanism in plants. Light-dependent anthocyanin biosynthesis in red turnip ‘Tsuda’ was found to be regulated by UV-A (320-380 nm) and co-irradiation of UV-B (2
英文关键词: Transposable elements;MITE;DNA methylation;;gene expression;anthocyanin biosynthesis