项目名称: 基于鲁棒多元隐特征模型的蛋白质相互作用网络建模与分析方法研究
项目编号: No.61402334
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2014
项目学科: 自动化技术、计算机技术
项目作者: 朱麟
作者单位: 同济大学
项目金额: 20万元
中文摘要: 蛋白质相互作用网络不仅为生物体的蛋白质组的全局作用结构提供了综合性的观察视角,也蕴含了特定蛋白质相互作用的细节信息。在本项目中,我们主要研究通过隐特征模型建模和分析蛋白质相互作用网络。首先,提出新颖的概率模型,连同特征表示一起,学习出非测度的相似度函数。其次,为了融合蛋白质本身的多源异构属性信息,我们提出基于深度学习的隐变量模型,同时将蛋白质原始特征和观测到的相互作用关系嵌入到隐空间中。最后为了提高蛋白质网络建模的鲁棒性,我们提出转换训练目标函数的思路。本项目可以深化对于蛋白质相互作用网络的研究,有助于获取对生物过程、功能和潜在复杂生物机制的新认识。
中文关键词: 蛋白质相互作用;隐变量模型;差异调控;;
英文摘要: Protein-protein interaction (PPI) networks provide a comprehensive view of the global interaction structure of an organism’s proteome, as well as detailed information on specific interactions. In the project, we investigate the modeling and analysis of PP
英文关键词: protein protein interaction;hidden variables model;Differences in regulation;;