项目名称: 复杂疾病中剪接相关的外显子分子逻辑挖掘方法的研究
项目编号: No.30900830
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2010
项目学科: 生物科学
项目作者: 杭兴宜
作者单位: 中国人民解放军军事医学科学院
项目金额: 20万元
中文摘要: 近年来以心脑血管疾病、恶性肿瘤、糖尿病等为代表的复杂疾病已经成为人类的致命杀手,严重影响人类健康和社会发展。由于复杂疾病的致病机理是基因-遗传-环境等多种因素交错的非线性关系,而且事实已证明以往基于单个基因的研究模式难以真正揭示复杂疾病的分子机制,因此采用高通量数据和系统生物学方法研究复杂疾病已渐次成为该领域的迫切需求。本课题拟在建立全新的外显子芯片(Exon array)数据分析平台的基础上,基于信息论中的分子逻辑方法,深化并扩展传统的基因网络系统生物学的范畴,分层并交互利用基因和外显子表达数据研究与异常剪接相关的复杂疾病中的外显子分子逻辑关系,力求发现以基因为载体的外显子功能模块,并通过功能注释挖掘这些模块和复杂疾病表型之间的关系。进而以申请者所在实验室产出的脑中风模型的外显子芯片数据为挖掘对象,发现脑中风相关的外显子分子逻辑,为此类疾病的诊断和治疗提供线索。
中文关键词: 复杂疾病;外显子芯片;可变剪接;分子逻辑;
英文摘要:
英文关键词: complex disease;exon array;alternative splicing;molecular logic;