新一代测序技术宏基因组数据分析的统计算法研究与应用

项目名称： 新一代测序技术宏基因组数据分析的统计算法研究与应用

项目编号： No.61370131

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 艾冬梅

作者单位： 北京科技大学

项目金额： 73万元

中文摘要： 近年来，革命性的新一代测序技术推动了宏基因组学的迅猛发展。随着测序手段的改变和数据复杂程度的增加，原有的计算生物和生物信息方法已不再适用。如何准确高速计算分析庞大复杂的新一代测序宏基因组数据，成为制约其进一步发展的瓶颈。本项目着重从宏基因组物种和功能组成丰度估计以及各成分间的关联性分析入手，针对新一代数据数量大，复杂度高，读片来源不确定的情况，研究准确、高效的分析宏基因组种群和功能基因丰度的统计算法，以及有效地发现和分析基因之间带延迟的局部二元或三元关联问题的统计算法。项目也将结合新兴的云计算手段实现上述算法，使之成为对生物学研究者和用户的透明简易可用的云服务分析平台，并使用模拟和实际数据来验证算法和软件服务。项目所设计的算法和服务可被广泛应用到宏基因组学研究中，夯实其分析的基础，提供新的理论和技术支持。

中文关键词： 宏基因组；相对丰度；统计显著性；功能基因组；核心基因组

英文摘要： Recent years, revolutionary next-generation sequencing (NGS) technology has greatly pushed the frontier of metagenomics research forward. However, as the NGS dataset become larger and more comprehensive, prevalent computational analysis methods have been

英文关键词： Metagenomics；Relative Abundance；Statistical Significance；Functional Genome；Core Genome