项目名称: 基于蛋白质复合物的关键蛋白质预测

项目编号: No.61402169

项目类型: 青年科学基金项目

立项/批准年度: 2014

项目学科: 自动化技术、计算机技术

项目作者: 任峻

作者单位: 湖南农业大学

项目金额: 26万元

中文摘要: 关键蛋白质是生物体生存和繁殖所必需的蛋白质,在生命活动中扮演重要角色。大多数关键蛋白质预测算法仅仅只根据蛋白质自身的特征对其关键性进行判断,而没有分析其他蛋白质的影响。然而,蛋白质的关键性往往依赖于蛋白质复合物的功能,而并不只由单一的蛋白质节点所决定。关键蛋白质往往大量富集于关键复合物中。针对这一点,本项目提出利用复合物预测关键蛋白质,研究内容包括:1)从生物意义出发,分析关键复合物与非关键复合物的各种生物特征,构建合理的关键复合物模型,设计有效的关键复合物挖掘算法;2) 分析关键复合物中蛋白质的关键性,设计有效的基于关键复合物的关键蛋白质挖掘算法;3)从生物意义出发,选择合适的关键蛋白质预测因子,将其与关键复合物信息结合,设计有效的基于多元数据的关键蛋白质预测算法。我们在预测蛋白质的关键性时,不仅考虑了蛋白质自身特征,同时考虑了其他蛋白质对其影响,这使得预测的准确性有望得到明显提高。

中文关键词: 关键蛋白质;关键复合物;多元数据;蛋白质复合物;

英文摘要: Essential proteins are those proteins which are indispensable to the viability and reproduction of an organism. They play an important role in cell activities. Most essential proteins prediction methods decide the essentiality of a protein only by feature

英文关键词: Essential protein ;Essential complex;Multivariate data;protein complex;

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