项目名称: CTCF介导染色质环调控血管生成素与核糖核酸酶-4基因差异表达的作用研究
项目编号: No.31400648
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2014
项目学科: 生物科学
项目作者: 盛静浩
作者单位: 浙江大学
项目金额: 25万元
中文摘要: 肿瘤相关蛋白核糖核酸酶-4(RNASE4)和血管生成素(ANG)均为核糖核酸酶A超家族成员,其基因前后排列在同一基因座上,共享启动子和非编码外显子,是人类基因组中一种非常罕见的基因组织方式。生物信息学分析显示,这两个基因在一些组织中存在着差异表达,但其调控机制未明。我们发现,ANG和RNASE4基因座上存在着一个由转录因子CTCF介导的基因内染色质环结构;过表达CTCF导致ANG表达水平显著提高,而RNASE4没有明显变化。在以上工作基础上,本项目拟进一步利用Reverse ChIP、ChIP-loop、3-C等技术,明确CTCF介导该特殊染色质环形成的具体机制;然后,利用CRISPR/CAS9基因编辑等技术,探索该染色质环在ANG和RNASE4基因差异表达中的作用;最后,在人体组织中验证以上发现。我们认为,该项目研究可能揭示生物体内基因表达调控的一种新机制。
中文关键词: 血管生成素;核糖核酸酶4;CTCF;染色质环;基因调控
英文摘要: Ribonuclease 4 (RNASE4) and angiogenin (ANG), two tumor-associated proteins, belong to the ribonuclease A superfamily. The locus encoding these two genes has a unique gene arrangement in whole human genome, in which the two genes share the same promoters
英文关键词: Angiogenin;Ribonuclease4;CTCF;Chromatin loop;Gene regulation