蛋白质组信息分析及应用算法研究

项目名称： 蛋白质组信息分析及应用算法研究

项目编号： No.60973082

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 自动化技术、计算机技术

项目作者： 廖波

作者单位： 湖南大学

项目金额： 29万元

中文摘要： 随着蛋白质组学研究近年高速的发展,需要进行蛋白质结构的预测、功能的识别、以及生物标记物的预测与鉴别等，传统的生物数据分析处理方法无法满足后基因组时代的需要，因此发展能快速计算分析获取蛋白质组信息的生物信息学方法成为关键性的基础问题。我们将基于代数学中的同态思想和物理学中的粗粒化思想，综合运用数学化的形式方法、系统生物学方法和信息学方法建立模型：利用序列的图形表示给出序列信息的一种离散度量方法，建立蛋白质组信息模型；利用模糊理论建立新的基于蛋白质组信息的系统发育分析模型及其统计校验方法；根据氨基酸的分类和重要的理化性质给出蛋白序列的编码方式并研究蛋白序列的L-Z复杂度，有效提取蛋白序列中氨基酸的相对分子量、等电点以及疏水性等信息，并初步应用于恶性肿瘤相关序列的相似性分析、蛋白质亚细胞定位预测、结构和功能靶标预测等热点领域；利用序列的新型表达模式给出点突变分析方法，寻求产生点突变的数学机理。

中文关键词： 蛋白质组信息学；系统发育分析；L-Z复杂度；突变分析；蛋白质亚细胞定位

英文摘要：

英文关键词： proteomic informatics；phylogeny analysis；L - Z complexity；mutation analysis method；subcellular prediction