棉花1号染色体上纤维长度QTL的精细定位及其候选基因的克隆

项目名称： 棉花1号染色体上纤维长度QTL的精细定位及其候选基因的克隆

项目编号： No.31171595

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 食品科学、农学基础与作物学

项目作者： 沈新莲

作者单位： 江苏省农业科学院

项目金额： 65万元

中文摘要： 在前期的研究中我们利用一个在1号染色体上含有海岛棉纤维长度QTL(qFL-chr1)的渐渗系，对目标QTL进行了初步精细定位。本研究拟在前期研究基础上，通过重复的表型鉴定将目标QTL精细、精确定位；然后进一步构建回交群体，通过前景选择与背景选择获得遗传背景相似度在99%以上且纤维长度明显优于轮回亲本的单QTL近等基因系；用RNA-Seq技术将单QTL近等基因系与轮回亲本进行转录组分析，获得差异表达基因；用单QTL近等基因系与轮回亲本构建一个F2小群体，进行pQTL与eQTL作图，获得与纤维伸长相关的候选基因。通过本研究，不但可以精细定位该纤维长度QTL，为标记辅助选择提供紧密连锁的标记；而且用所获得的单QTL近等基因系结合遗传基因组学研究手段，克隆与纤维伸长相关的候选基因，探索在复杂的基因组中克隆QTL的新途径。

中文关键词： 棉花；纤维长度；近等基因系；eQTL；

英文摘要：

英文关键词： Gossypium；Fiber length；NIL；eQTL；