基于宽泛种质和综合鉴定策略的玉米基因组结构变异分析

项目名称： 基于宽泛种质和综合鉴定策略的玉米基因组结构变异分析

项目编号： No.31371638

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 农业科学

项目作者： 邹枨

作者单位： 中国农业科学院作物科学研究所

项目金额： 80万元

中文摘要： 结构变异(Structure variation，SV)是玉米遗传多样性与表型变异的重要来源，系统鉴定与阐明玉米基因组SV将为玉米结构基因组学与功能基因组学奠定重要的分析基础，具有重要的理论与实践意义。近年来，生物信息学系统分析与鉴定玉米基因组SV及其与重要农艺性状的关系，主要以B73为参考基因组，且集中于温带玉米种质，数据与结果上均存在偏倚性。本项目拟在已掌握的大量温带与热带玉米基因组数据的基础上，采用分裂读取、读深与从头组装综合分析策略，研究SV类型、多态性、产生机制及其在温带与热带材料之间的分布特征，并在此基础上，选择若干代表材料，深入研究特定SV对全基因组基因表达影响。本研究将为复杂植物基因组SV鉴定建立重要方法与分析策略，揭示玉米基因组SV类型及其产生机制，并有可能揭示重要结构变异对基因表达调控网络的影响，为研究SV对重要农艺性状的影响奠定基础。

中文关键词： 热带玉米；结构变异；；；

英文摘要： Genomic structural variation is one of the main sources of genetic and phenotypic variation.New sequencing platforms and hybridization-based strategies have appeared over the past decade which are being applied to maize, providing genome-wide comprehensi

英文关键词： tropical maize；structural variation；；；