项目名称: 人类胞内短寿命蛋白泛素化降解及其调控的序列与结构基础
项目编号: No.61171191
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2012
项目学科: 无线电电子学、电信技术
项目作者: 宋晓峰
作者单位: 南京航空航天大学
项目金额: 60万元
中文摘要: 人类胞内短寿命蛋白泛素化降解对维持细胞生理功能至关重要,国内外研究表明序列与结构对其泛素化降解起内在决定作用。前期我们针对高通量全蛋白稳定性数据,从整体序列与结构信息中分析得到疏水性、含硫量、信号肽等多个影响短寿命蛋白泛素化降解的弱信号。在此基础上,我们推测功能偶联位点局部序列与结构中可能存在泛素化降解的强信号。因此,本项目拟采用"统计偶联分析"建立短寿命蛋白泛素化位点、E3酶活性位点统计能量偶联谱;通过分析功能位点及空间结构上距离较远的强偶联位点的局部序列和三级结构信息,建立人类胞内蛋白泛素化修饰位点模型,研究影响E3酶活性的关键因素,进而阐明E3酶对底物蛋白泛素化降解的调控作用;最后通过分子动力学模拟研究E3酶和底物蛋白的动态构象变化规律,以揭示泛素转运、E3酶活性调控的结构机理。本项目成果有助于理解人类胞内短寿命蛋白泛素化降解及其调控的分子机制,对癌症防治或药物研发提供有价值线索。
中文关键词: 泛素化位点;蛋白质稳定性;E3酶底物;蛋白质三维结构;凹凸指数
英文摘要:
英文关键词: ubiquitination site;protein stability;E3 enzyme substrate;protein 3D structure;concave-convex index