项目名称: 建立基于混合人群的基因相互作用研究策略:新疆典型混合人群的全基因组研究
项目编号: No.31171218
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2012
项目学科: 遗传学与生物信息学、细胞生物学
项目作者: 徐书华
作者单位: 中国科学院上海生命科学研究院
项目金额: 70万元
中文摘要: 基因变异和性状变异是基因相互作用研究的数据基础。普通人群由于历史原因和长期适应特定环境,很多性状变异和基因变异在群体内固定或丢失,导致基因互作研究所需的变异信息量极大降低或缺失。而同时研究不同人群来源的样本虽可增加变异信息量却又难以避免样本所处不一致环境因素的干扰。由人群融合产生的混合人群不但性状变异和基因变异都显著高于普通人群,而且所处环境影响因素一致,因而成为基因互作研究的天然素材和优良载体。本项目拟采用全基因组基因分型和表达谱微阵列技术,基于基因变异和表达数量性状,充分利用混合人群的独特优势,发展针对性的研究方法并搭建计算生物学分析平台,系统地开展以新疆典型混合人群为模型的基因相互作用研究。本项目利用特殊遗传资源从新的角度建立基因相互作用的研究体系,有助于"基因型-表型"研究框架的进一步建设和发展,为最终阐明复杂性状的遗传学基础和调控网络提供数据资源、研究方法、分析平台和参考性案例。
中文关键词: 基因相互作用;新疆混合人群;基因变异;表达谱;基因表达数量性状
英文摘要:
英文关键词: Gene-gene interaction;Admixed population;Genetic variation;Gene expression profile;Expression quantitative trait