项目名称: 宁夏回族人群非综合症唇腭裂候选基因和位点的关联性研究
项目编号: No.81160131
项目类型: 地区科学基金项目
立项/批准年度: 2012
项目学科: 医学二处
项目作者: 黄永清
作者单位: 宁夏医科大学
项目金额: 52万元
中文摘要: 本研究根据目前最新的三个NSCL/P的GWAS研究结果,选择了其中最有意义的IRF6,MAFB两个基因和8q24.21区段作为候选基因和区段,研究在宁夏回族人群中与NSCL/P的相关性。拟收集300个 NSCL/P三人核心家系及300名对照组。首先选择小样本进行个性化目标候选基因和区域捕获测序,针对性筛查、发现新的和验证候选的遗传变异SNPs, CNVs位点和区域。再在大样本中对上一步精选验证的SNP和CNV检测验证。应用病例-对照和传递不平衡(TDT)方法进行关联研究。通过分析父母 - 子女对(Trios )样本,比较子女与父母的SNPs差异,来发现子女与父母传递CNVs的差异。应用实时荧光定量PCR和多重连接探针扩扩增法(MLPA)以及FISH的方法验证不符合孟德尔传递规律的新的CNVs的准确性。探讨宁夏回族人群中遗传变异与NSCL/P的关联性。
中文关键词: 非综合征型唇腭裂;全基因组关联分析研究;单核苷酸多态性;全外显子捕获测序技术;
英文摘要:
英文关键词: NSCL/P;GWAS;SNP;Exon Trapping Sequencing Technology;