甲型H3N2流感病毒抗原蛋白HA抗原性漂移的生物信息学研究

项目名称： 甲型H3N2流感病毒抗原蛋白HA抗原性漂移的生物信息学研究

项目编号： No.31171272

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 生物科学

项目作者： 曹志伟

作者单位： 同济大学

项目金额： 60万元

中文摘要： 以甲流为代表的流感病毒长期威胁人类健康，其主要抗原不断快速突变引起抗原性漂移从而导致免疫逃逸是目前流感难以得到有效预防的主要原因。甲型流感病毒主要抗原蛋白的基因突变可以预测么？哪些突变有可能引起抗原性漂移而需要格外重视？现有甲型流感病毒数据能否支持预测模型的建立？本团队前期收集了大量病毒序列和相关试验结果，经过预试验发现此研究方向具有可行性。本项目以数据量最为丰富的甲型H3N2流感病毒抗原蛋白HA为研究对象，建立HA基因特异的进化突变概率矩阵，引入抗原性区域突变程度和抗原性漂移距离的相关性度量；然后利用上述模型开展HA抗原性漂移的预测，给出导致抗原性漂移的潜在突变基因型集合，并通过血凝（及抑制）试验结果反馈改进整个研究流程。针对流感的免疫信息学是国际上刚刚兴起的前沿交叉学科，本项目的预期成果一方面可以揭示甲型流感病毒抗原性漂移的机制，另外也对该病毒预防性疫苗的设计提供一定的理论支持。

中文关键词： 流感病毒；血凝素蛋白；抗原性位点；抗原性漂移；空间表位

英文摘要：

英文关键词： influenza；hemagglutinin；antigenic site；antigenic drift；structure epitope