项目名称: 基于数据整合的飞蝗两型分子网络构建与比较分析
项目编号: No.31401121
项目类型: 青年科学基金项目
立项/批准年度: 2014
项目学科: 生物科学
项目作者: 杨鹏程
作者单位: 中国科学院动物研究所
项目金额: 20万元
中文摘要: 飞蝗的群居型和散居型间的相互转变是其形成危害的关键行为特征,也是表型可塑性研究的著名例子。两型转变的分子机理研究对蝗灾治理起到关键作用。近年来,我们研究组阐述了飞蝗两型各种组学水平的差异,破解了该物种的基因组序列,并构建了RNAi干扰系统和行为学观测系统。在此基础上,本研究针对东亚飞蝗:1)对两型差异表达基因差异表达的程度和范围广度进行系统分类和总结;2)重构飞蝗的分子网络,包括:基于蛋白同源关系构建飞蝗全基因组蛋白相互作用网络、分别构建两型有权重的共表达网络;3)整合两型基因表达数据,比较分析两型组织间、发育阶段间、两型转变过程间差异分子在蛋白相互作用网络上的差异,比较分析两型共表达网罗的差异。通过基于数据整合的网络水平分析,以期深化对飞蝗两型转变机制的理解,为寻找新的蝗灾治理策略和方法提供理论依据。
中文关键词: 飞蝗;表型可塑性;转录调控网络;转录组数据整合;
英文摘要: Phase change between gregarious and solitarious locust is the key behavior features for locust’s agricultural damages, is also one famous example of polyphenism. In recent years, our lab have elaborated the differences of locust phase change at various om
英文关键词: locust;phenotypic plasticity;transcriptional regulatory network;transcriptome data integration;