加工番茄可溶性固形物含量的全基因组关联分析与连锁作图

项目名称： 加工番茄可溶性固形物含量的全基因组关联分析与连锁作图

项目编号： No.31171962

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 植物保护学、园艺学与植物营养学

项目作者： 宋燕

作者单位： 中国农业科学院蔬菜花卉研究所

项目金额： 62万元

中文摘要： 针对栽培种番茄(S. lycopersicum)遗传背景狭窄，严重缺乏可用于挖掘其遗传多样性的标记；番茄关联作图滞后；我国加工番茄产业急需优良新品种；遗传资源匮乏等系列科学和实际生产问题。 项目拟基于已完成的番茄全基因组测序和重测序的序列，开发大量InDel、SNP、SSR等高信息量和高通量标记，通过分析番茄亚群体"加工番茄"的遗传多样性，构建我国加工番茄核心种质资源库；结合遗传连锁和关联作图(Linkage and association mapping)，获得与加工番茄关键性状可溶性固形物含量(soluble solids content,SSC%)相关的重要基因组区段/基因簇/基因/等位基因紧密连锁的标记或功能标记，用于辅助选育。研究结果将揭示关联和连锁作图结合挖掘番茄QTL的潜力，初步建立加工番茄分子设计育种技术体系，提升我国加工番茄育种的整体水平。

中文关键词： 加工番茄；核心种质；可溶性固形物；醋栗番茄；全基因组关联分析

英文摘要：

英文关键词： processing tomato；core collection；Brix content；Solanum pimpinellifolium；GWAS