This work addresses the critical challenge of optimal filter selection for a novel trace gas measurement device. This device uses photonic crystal filters to retrieve trace gas concentrations affected by photon and read noise. The filter selection directly influences the accuracy and precision of the gas retrieval and, therefore, is a crucial performance driver. We formulate the problem as a stochastic combinatorial optimization problem and develop a simulator modeling gas retrieval with noise. Metaheuristics representing various families of optimizers are used to minimize the retrieval error objective function. We improve the top-performing algorithms using our novel distance-driven extensions, which employ metrics on the space of filter selections. This leads to a new adaptation of the Univariate Marginal Distribution Algorithm (UMDA), called the Univariate Marginal Distribution Algorithm Unified by Probabilistic Logic Sampling driven by Distance (UMDA-U-PLS-Dist), equipped with one of the proposed distance metrics as the most efficient and robust solver among the considered ones. We apply this algorithm to obtain a diverse set of high-performing solutions and analyze them to draw general conclusions about better combinations of transmission profiles. The analysis reveals that filters with large local differences in transmission improve the device performance. Moreover, the obtained top-performing solutions show significant improvement compared to the baseline.


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