第一代小麦单倍型作图

项目名称： 第一代小麦单倍型作图

项目编号： No.31271292

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 高丽锋

作者单位： 中国农业科学院作物科学研究所

项目金额： 95万元

中文摘要： 单倍型图谱在作物科学研究领域具有十分重要的意义,可以大大简化复杂基因组研究。小麦是世界重要的粮食作物之一，由于其基因组复杂且庞大，迄今还没有一个完整的单倍型图谱。本研究基于前期对10份小麦材料测序并设计100K iSelect SNP芯片，收集了一套多样性丰富的由84份野生小麦、150份地方小麦和150份现代育成小麦品种组成的群体，拟通过分析这384份小麦材料中的100K SNPs，明确小麦基因组中haplotypes的数量、大小、分布特点，并找出识别haplotypes的标签SNPs (tag SNPs)。根据tag SNPs在小麦遗传图谱上的位置，构建第一代小麦HapMap。该图谱及其材料将成为今后小麦功能基因组研究、小麦遗传育种、小麦种质资源研究的基础，对于小麦科学的发展发挥极大的作用，并对禾本科作物的比较基因组学做出贡献。

中文关键词： 小麦；驯化；育种；选择；多样性

英文摘要： HapMap is of great importance in crop science which can greatly simplify the study of complex genomes. Wheat is one of the most important food crops in the world, however, wheat HapMap is not available till now due to its huge and complex genome. A 100K SNP iSelect array is under development based on sequencing and resequencing of 10 wheat lines, and a panel of wheat lines including 84 wild relatives, 150 landraces, and 150 modern varieties is collected by our research group. We hope to clarify the characteristics of haplotypes throughout wheat genomes by analyzing variations of the 100K SNPs across the 384 wheat lines, and tag SNPs for each haplotype will be identified. The first-generation HapMap of wheat will be drawn by aligning the tag SNPs to scaffolds which have been mapped on genetic maps previously. Such a HapMap will be research basis for wheat functional genomics, genetic breeding and germplasm.

英文关键词： wheat；domestication；improvement；selection；diversity