杨树基因组未定位序列骨架的染色体组装

项目名称： 杨树基因组未定位序列骨架的染色体组装

项目编号： No.30971609

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 生物科学

项目作者： 尹佟明

作者单位： 南京林业大学

项目金额： 32万元

中文摘要： 杨树作为第一个完成全基因组测序的木本植物,已使杨树成为研究木本植物基因组的模式材料受到越来越多的关注。大量比较基因组及功能基因组研究的工作正以杨树为研究材料展开。精确而完整的基因组序列组装是开展杨树后基因组研究的一个基础和前提。然而已公布的杨树基因组序列仅完成了385MB的基因组序列沿染色体的组装，还有约100 MB的杨树基因组序列仍然散布于没有定位于染色体的2，000多个序列骨架上，这对于杨树基因组序列的应用产生了很大限制。国际上先后开展了大量的研究工作致力于完善杨树基因组序列的组装。申请人长期以来，致力于这一研究工作，本项目拟在现有工作的基础上，采用前期工作中证明的最为有效的方法，使杨树基因组的组装覆盖度显著提高，同时产生杨树重要性状基因定位的基本群体，及杨树遗传分析与基因克隆的操作平台。本项目对丰富和充分利用杨树基因组信息，促进我国林木基因组研究和杨树遗传改良进程有重要意义。

中文关键词： 杨树基因组；序列骨架；遗传作图；功能基因组；

英文摘要：

英文关键词： Poplar genome；sequence scaffold；genetic mapping；functional genomics；