荧光组合编码的高通量DNA连接测序方法研究

项目名称： 荧光组合编码的高通量DNA连接测序方法研究

项目编号： No.61201343

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 无线电电子学、电信技术

项目作者： 涂景

作者单位： 东南大学

项目金额： 27万元

中文摘要： 针对现有的高通量DNA测序无法实现在一轮反应中测定2位或多位碱基信息的的问题，以测序信号类型和碱基类型之间的编码关系为研究对象，采用组合荧光的编码方法，利用多种荧光基团组合标记同一条寡核苷酸探针，修饰不同寡核苷酸探针的荧光基团的组合类型各不相同。对不同的荧光基团组合方案进行比较，优化连接测序流程，分析各个方案在进行测序图像碱基识别时优缺点，并利用该方案进行转录组分析。项目预期将在测序信号与待测碱基（寡核苷酸）之间发展建立一种更加高效的编码方式，充分利用不同测序信号间的编码空间，提高新一代DNA测序平台的读长、通量速度和准确率等指标，为更加高效地获取核酸信息提供一种新的思路和手段，同时也还为基因组学、转录组学和表观遗传学研究等提供一个更加高效的技术手段。

中文关键词： 基因测序；高通量测序；荧光编码；；

英文摘要： The existing high-throughput DNA sequencing platforms can not obtain the sequence information of two or more bases in one sequencing round. According to this problem, we study on the coding mode between the sequencing signals and nucleotides (or oligos),

英文关键词： DNA Sequencing；High-throughput sequencing；fluorescent coding；；