肠炎-癌转化中小RNA体内靶基因的鉴定和预测算法的研究

项目名称： 肠炎-癌转化中小RNA体内靶基因的鉴定和预测算法的研究

项目编号： No.91429301

项目类型： 重大研究计划

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 韩家淮

作者单位： 厦门大学

项目金额： 250万元

中文摘要： 小RNA可调控包括炎症、癌症等许多生理进程中的重要基因表达。虽然已有多种小RNA靶基因预测算法，但对寻找小RNA体内靶基因的帮助还很有限。本课题针对上轮课题研究中所遇到的问题？无法准确全面地鉴定小RNA在炎症肠上皮中的靶基因，计划基于近期通过结合基因组学、定量蛋白质组学和多核糖体展示等多种方法所鉴定到的miR-17～92族小RNA在原代B细胞中的真实靶向基因的数据，发展一种新的小RNA靶基因预测算法；以肠炎相关的肠癌为模型，运用上述可行的多种技术的结合，鉴定miR-17～92家族小RNA在炎症肠上皮细胞中的靶基因，研究其对炎-癌转化的影响；肠上皮实验所得到的数据还将用来验证和优化我们开发出来的小RNA靶基因预测算法；然后运用此算法于miR-21在肠炎-癌转化中作用的研究中。我们的工作将会促进人们对于小RNA在肠炎诱发的肠癌中作用的理解，同时提供一个有效的小RNA体内靶基因的预测算法。

中文关键词： 小RNA；预测算法；肠炎相关肠癌；；

英文摘要： MicroRNAs (miRNAs) regulate gene expressions in a variety of cellular processes such as inflammation and cancer. Although a number of miRNA target prediction algorithms are available, their role in finding miRNA’s in vivo target genes is very limited. Thi

英文关键词： microRNA；prediction algorithm；colitis-related colon cancer；；