蛋白质超二级结构及其特殊模体的理论研究

项目名称： 蛋白质超二级结构及其特殊模体的理论研究

项目编号： No.30960090

项目类型： 地区科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 生物科学

项目作者： 胡秀珍

作者单位： 内蒙古工业大学

项目金额： 24万元

中文摘要： 后基因组时代最有意义和最具挑战性的工作之一是蛋白质的结构和功能注释，然而用实验手段解决这些问题不但耗资、耗时，而且还存在着无法解决的技术上的困难。因此在理论上研究并预测蛋白质的结构和功能是生物信息学的重要研究课题。目前，直接从序列信息预测蛋白质的结构还很困难，蛋白质超二级结构及其特殊模体的信息研究和预测是三级结构预测的桥梁，对蛋白质的折叠、识别、稳定性起重要作用，还能为新药设计提供分子模板信息。本项目以已知结构的蛋白质数据库为基础，从蛋白质序列出发，利用物理学、生物信息学、信息学等理论方法和计算机技术相结合，在理论上研究蛋白质超二级结构及其特殊模体。主要研究超二级结构及其特殊模体的序列特征在统计意义上的规律；发展超二级结构及其特殊模体预测的新方法；探索功能位点的氨基酸构成；研制超二级结构及其特殊模体预测的软件原型系统。

中文关键词： 蛋白质；超二级结构；β#21457;夹模体；β#945;-β27169;体；预测

英文摘要：

英文关键词： protein；supersecondary structure；βairpin motif；β#945;-βotif；prediction