项目名称: 水稻抗旱基因网络重建及关键节点基因OsHSF01的功能鉴定
项目编号: No.31371229
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2013
项目学科: 生物科学
项目作者: 张利达
作者单位: 上海交通大学
项目金额: 80万元
中文摘要: 水稻抗旱机制十分复杂,而缺乏对抗旱基因相互协作关系的全面认识,严重制约了水稻抗旱品种的分子设计育种。故我们采用网络生物学研究策略来促进抗旱新基因发现、加深对抗旱分子机制的认识。本研究将综合多种生物信息数据与资源,构建水稻抗旱基因网络模型,结合水稻抗旱性状GWAS数据,探明控制水稻抗旱性的基因模块及关键基因。结合前期网络解析提出"水稻中存在一个依赖ABA信号调控、以OsHSF01为核心连接根部发育和气孔运动的抗旱基因网络"的假设,进一步通过过表达与抑制表达等实验,评价OsHSF01基因在水稻抗旱中的功能;并对转基因水稻根系发育特征与叶片生理性状进行研究,明确其作用途径。通过ChIP-seq分析,结合转基因水稻转录组变化,探明受OsHSF01直接调控的下游基因及参与的网络通路,力争在OsHSF01抗旱基因网络及调控机制方面获得有创新意义的进展或突破,为较全面的认识水稻抗旱分子机制提供新的视角。
中文关键词: 水稻;蛋白质互作;基因网络;抗旱;热激转录因子
英文摘要: Drought tolerance is a very complex trait, controlled by many genes, and its molecular mechanism is still unclear. Therefore, we propose to adopt the network biology research strategy to facilitate gene discovery and to better understand the molecular mec
英文关键词: rice;protein interaction;gene network;drought tolerance;heat shock transcription factor