项目名称: 基于模式识别的新疆紫草细胞培养物代谢组学研究
项目编号: No.61173098
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2012
项目学科: 计算机科学学科
项目作者: 王红
作者单位: 中国科学院大学
项目金额: 57万元
中文摘要: 新疆紫草为传统药用植物,其主要有效成份为萘醌类化合物紫草素及其衍生物,具有重要的药用价值,但野生资源非常有限,近年来已呈匮乏之势。本实验室已建立的新疆紫草细胞培养体系成功解决了新疆紫草的资源问题。本项目旨在利用先进的模式识别和机器学习技术,研究新疆紫草细胞培养物紫草素及其衍生物的合成与其它相关代谢物合成的定性和定量关系,阐明主要的影响因素,并建立相关的计算分析模型,为新疆紫草细胞培养物紫草素及其衍生物合成的调控及代谢工程提供理论基础。主要研究内容包括:1)建立新疆紫草细胞培养物不同细胞系在不同培养时期、不同环境条件下的萘醌类代谢组数据库;2)利用现代模式识别理论、图像分析和机器学习技术分析其萘醌类代谢组的差异,并结合其它资料,解析差异的原因,建立数学模型,预测哪些环境条件有利于新疆紫草培养细胞萘醌类化合物的合成,为新疆紫草培养细胞萘醌类化合物合成的调控提供理论指导。
中文关键词: 模式识别;新疆紫草;生物信息;代谢组学;
英文摘要:
英文关键词: pattern recognition;Arnebia euchroma;bioinformation;metabonomics;