模式原生动物嗜热四膜虫DNA复制起点的鉴定及其特征分析

项目名称： 模式原生动物嗜热四膜虫DNA复制起点的鉴定及其特征分析

项目编号： No.31301930

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 熊杰

作者单位： 中国科学院水生生物研究所

项目金额： 24万元

中文摘要： 针对DNA复制起点的研究在原生动物类群中的缺乏，且一些基于基因组层面的DNA复制起点鉴定方法还存在缺陷这两大问题。本项目提出以模式原生动物嗜热四膜虫为研究对象、以高通量测序和生物信息学技术为主要手段、通过检测组蛋白3第27号赖氨酸单甲基化（H3K27me1）缺陷型细胞中的单链DNA，从而实现对嗜热四膜虫中DNA复制起点的鉴定及其特征分析。项目的实施不仅将填补相关领域的研究空白并增进对真核生物DNA复制起点及其特征的认识，而且将开辟在真核生物中鉴定DNA复制起点的又一新方法，对进行类似研究具有重要的指导意义。

中文关键词： 模式生物嗜热四膜虫；全基因组；DNA复制起点；核小体分布图；分布特征

英文摘要： Study of DNA replication origins identification is absent in protozoa, and there are some disadvantages of the genome-wide DNA replication origin identification methods. Focusing on these questions, this project will identify the DNA replication origins in model protozoa Tetrahymena thermophila, and analyze their characters by detecting the ssDNA in H3K27me1 deficient cells using high-throughput sequencing techniques and bioinformatics methods. The implementation of this project will not only fill the gap in related field and enhance the understanding of eukaryotic DNA replication origins and their characteristics,but also establish a new genome-wide DNA replication origin identification method and give a important reference to similar studies.

英文关键词： Model organism Tetrahymena thermophila；Genome wide；DNA replication origin；Nucleosome map；Distribution characters