基于GWAS基础的肉牛肉质性状候选基因功能研究

项目名称： 基于GWAS基础的肉牛肉质性状候选基因功能研究

项目编号： No.31372294

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 农业科学

项目作者： 李俊雅

作者单位： 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所

项目金额： 82万元

中文摘要： 牛肉品质的形成受遗传背景、营养、饲养方式等多重因素影响，其中遗传因素最为重要和复杂。牛肉质性状在遗传层面上是受多基因调控的数量性状。全基因组关联分析为发现调控牛肉品质的数量性状基因座提供了必要的方法和技术，但若揭示其调控机理尚需进一步深入研究。本研究拟在申请人研究团队已开展的肉牛全基因组关联分析结果的基础上，采用DHPLC和TOF-MS法对QTL区间SNP进行筛查和分型；通过对表型和SNP基因型关联分析实现对QTL区间精细定位并确定候选基因；通过构建过表达载体和干扰载体研究候选基因对细胞功能的影响；通过显微注射法、打靶载体构建转候选基因和基因敲除小鼠模型，研究活体水平候选基因功能；通过酵母双杂交、ChIP-seq等方法，研究候选基因与其它细胞因子或DNA的相互作用。该研究将更加精细定位前期GWAS所得到的QTL至基因水平，揭示候选基因影响肉质性状的生物学机理，为肉牛育种提供可靠的理论依据。

中文关键词： 肉牛；经济性状；重测序；全基因组关联分析；基因功能

英文摘要： Beef quality is controlled by multi factors such as genetic background, nutrition, raising pattern and so on. The effect of genetic background is the most important among the factors. Beef quality is a quantitative trait that regulated by multi genes. Gen

英文关键词： beef；economic traits；resequencing；GWAS；gene function