CA-rich顺式元件及其相互作用的反式因子对可变剪接的调控机制

项目名称： CA-rich顺式元件及其相互作用的反式因子对可变剪接的调控机制

项目编号： No.30970620

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 生物科学

项目作者： 惠静毅

作者单位： 中国科学院上海生命科学研究院

项目金额： 32万元

中文摘要： 在高等真核生物中，可变剪接是增加基因组多样性与调控基因表达的重要机制，可影响生理与病理条件下各种细胞活动。mRNA前体中存在的顺式元件及其相互作用反式因子在可变剪接调控中发挥关键作用。文献报道，CA-rich顺序有引起可变剪接的功能，但其分子机制不清楚；反式因子YB-1能结合CA-rich顺序并增强可变剪接，而如何调控CA-rich顺序功能机制也不清楚，而其在肿瘤细胞高表达，且与肿瘤细胞的生长、转移与耐药性密切相关。本项目以CD44外显子v4-v7为可变剪接模型，研究CA-rich顺序引起可变剪接、反式因子如YB-1等调控CA-rich顺序功能的分子机制，利用进一步确定的YB-1结合RNA序列在基因组水平高通量寻找YB-1靶基因并分析其调控可变剪接的规律性。通过本项研究，以期阐明CA-rich顺式元件、YB-1等反式因子调控可变剪接的分子机制，并为肿瘤的分子诊断与治疗提供新的视野。

中文关键词： 可变剪接；CA-rich顺式元件；YB-1；U2AF；3’#21098;接位点的识别

英文摘要：

英文关键词： alternative splicing；CA-rich element；YB-1；U2AF；3’splice site recognition