面向蛋白质柔性建模的特征设计与智能算法研究

项目名称： 面向蛋白质柔性建模的特征设计与智能算法研究

项目编号： No.61170099

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 计算机科学学科

项目作者： 张华

作者单位： 浙江工商大学

项目金额： 55万元

中文摘要： 传统的蛋白质科学研究遵循"序列-结构-功能"的范式，而随着实验数据的积累，人们逐渐意识到柔性对蛋白质功能的至关重要性。要真正了解蛋白质的"序列-结构-柔性-功能"这种新范式，还有大量的工作需要开展。目前，柔性建模已是蛋白质结构学中的一个研究热点，除实验方法外，主要分成物理计算模型和智能计算两大部分，各类计算方法都存在一定的优缺点。其中，智能计算方法具有成本低、高效、数据处理规模大等特点，但应用于柔性预测研究才刚刚起步，还有待进一步的深入研究。 本项目拟集中或结合智能计算与高斯网络模型各自的优点，设计新的特征向量，利用多种（混合的）智能计算方法，从氨基酸序列或蛋白质结构出发，建立起一系列各具特色的高精度柔性预测模型，并进一步系统性地对各类柔性数据进行预测和分析。蛋白质柔性的精确建模可以为药物设计、蛋白质结构预测、分子柔性对接等重大课题提供理论基础。

中文关键词： 蛋白质；柔性建模；智能计算；高斯网络模型；溶剂可及性

英文摘要：

英文关键词： protein；flexibility modeling；intelligent computing；Gaussian network model；solvent accessibility