苜蓿共生结瘤体系响应重金属铜胁迫的转录组研究

项目名称： 苜蓿共生结瘤体系响应重金属铜胁迫的转录组研究

项目编号： No.31172252

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 畜牧学与草地科学、兽医学、水产学

项目作者： 丑敏霞

作者单位： 西北农林科技大学

项目金额： 62万元

中文摘要： 以具有西部地域特征的、重金属抗性的天蓝苜蓿（Medicago lupulina L.）―-苜蓿中华根瘤菌（Sinorhizobium meliloti CCNWSX0020）共生固氮体系为模式，应用最新发展起来的RNA-Seq 技术分别对铜离子胁迫和非胁迫条件下接种根瘤菌后天蓝苜蓿根组织中的转录本测序，通过与苜蓿全基因组的比较，分析天蓝苜蓿共生结瘤体系在铜离子胁迫和非胁迫两种生长条件下相关基因的转录表达水平及基因转录体的结构，寻找新转录本和新外显子；分析基因转录体的可变剪接种类和数量并通过qPCR验证，推测天蓝苜蓿中可变剪接的可能发生机制；分析两种培养条件下的差异表达基因并进行GO功能富集分析和KEGG代谢途径分析，从而于转录组水平上系统研究铜离子影响天蓝苜蓿与根瘤菌共生互作的分子机理，为重金属胁迫下豆科植物共生互作机制的最终阐明奠定基础。

中文关键词： 天蓝苜蓿；共生固氮；铜胁迫；转录组测序；差异表达基因

英文摘要：

英文关键词： Medicago lupulina L.；symbiotic nitrogen fixation；copper stress；RNA-Seq；differentially expressed genes