对虾基因组DNA重复序列的分析和定位研究

项目名称： 对虾基因组DNA重复序列的分析和定位研究

项目编号： No.31172396

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 畜牧学与草地科学、兽医学、水产学

项目作者： 张晓军

作者单位： 中国科学院海洋研究所

项目金额： 60万元

中文摘要： 研究表明对虾基因组中DNA重复序列占有很大比例，但目前关于这些重复序列一些基本特性的了解还不十分清楚。本课题在分析对虾类基因组高通量测序数据、BAC末端序列的基础上，结合已测序的Daphnia pulex等近缘物种的基因组数据，采用生物信息学分析和测序的方法，了解对虾基因组中重复序列的特点；在此基础上筛选、合成探针，对端粒、着丝粒、rDNA、histone、actin和一些LINE等重复序列，通过Southern blot和荧光原位杂交(FISH)的方法确定其在染色体上的分布和位置。这些重复序列的分析、克隆和定位将有助于对虾染色体物理图谱构建和基因组测序组装，为深入了解对虾基因组的组成、结构及功能，促进对虾遗传育种和系统进化研究提供基础。

中文关键词： 对虾；重复序列；基因定位；基因组组装；系统进化

英文摘要：

英文关键词： Shrimp；Repeat sequence；Gene location；Genome assembly；Molecular evolution and phylogenetics