基于可变串联重复序列的溶藻弧菌基因分型及基因组多态性研究

项目名称： 基于可变串联重复序列的溶藻弧菌基因分型及基因组多态性研究

项目编号： No.31170008

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 微生物学、植物学

项目作者： 李艳君

作者单位： 中国人民解放军海军总医院

项目金额： 60万元

中文摘要： 溶藻弧菌在海水和各类海产品中分布广泛，具有引发大规模食源性中毒事件的潜在危险，同时可导致多器官组织的感染，给渔民和海上作业人员的健康带来一定威胁。然而目前溶藻弧菌的各方面研究还不够深入，尤其是基因分型及基因组多态性研究更是鲜有报道。本研究拟在前期研究的基础上探索以下科学问题：1）利用生物信息学方法对完成测序溶藻弧菌12G01和40B基因组中的VNTR位点进行分析和筛选,以获得适用于分型进化研究的多态性位点；2）应用所选位点对收集的地域分布广阔的多样性菌株进行多位点VNTR分析，探讨溶藻弧菌各基因型的地域分布特征和遗传进化关系；3）建立基于VNTR技术的溶藻弧菌基因分型系统和鉴定溯源数据库，积累数据，用于由溶藻弧菌引起食物中毒事件的病原菌溯源调查和流行病学监控。本研究拟对溶藻弧菌进行系统的基因分型，为流行病学调研提供分子基础和数据参考，具有一定的科学意义和应用前景。

中文关键词： 溶藻弧菌；VNTR；基因分型；多态性；

英文摘要：

英文关键词： Vibrio alginolyticus；VNTR；Genotyping；Polymorphism；