准噶尔荒漠鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因组多态性研究

项目名称： 准噶尔荒漠鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因组多态性研究

项目编号： No.30960348

项目类型： 地区科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 金属学与金属工艺

项目作者： 戴翔

作者单位： 新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心

项目金额： 25万元

中文摘要： 准噶尔荒漠鼠疫疫源地是2005年在新疆新发现的一类鼠疫自然疫源地，其菌株基因组多态性信息基本为空白。本研究拟选择该疫源地分离菌株以及临近疫源地的代表性菌株，利用全基因组芯片杂交、DFR分析、SNP分析、MLVA分析、CRISPR分析、IS插入序列分析等技术手段，从基因获得与缺失、点突变、重复序列、基因组重排等方面研究其基因组多态性，初步阐述该疫源地菌株基因组型别和基因组多态性特征，并建立菌株基因组多态性数据库；结合菌株营养型、毒力等表型信息和流行病学数据，与临近疫源地菌株进行比较，可以勾勒该疫源地菌株基因组微进化与菌株生态位适应、鼠疫疫源地扩散之间的联系。通过比较该疫源地菌株与相邻的中亚沙鼠疫源地菌株之间的基因组比较，初步阐明该疫源地与中亚疫源地的关系。本研究可从基因组水平全面解析该疫源地菌株特性，进而为病原体检测，以及突发鼠疫的溯源诊断和疫情判定等提供技术支持和理论基础。

中文关键词： 鼠疫菌；自然疫源地；基因组多态性；微进化；

英文摘要：

英文关键词： isolates；plague nature foci；genome polymorphism；microevolution；