一文读懂 PyTorch 显存管理机制

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一文读懂 PyTorch 显存管理机制

2022 年 4 月 3 日 极市平台

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作者丨米阿罗@知乎（已授权）

来源丨https://zhuanlan.zhihu.com/p/486360176

编辑丨极市平台

首发于踢翻炼丹炉：https://www.zhihu.com/column/c_1320691511223136256

二次转载须经作者授权

极市导读

本文细致的对PyTorch 显存管理机制进行了剖析，包括：寻找合适的block的步骤、实现自动碎片整理详解等，希望本文能帮助大家更透彻的理解显存优化。 >>加入极市CV技术交流群，走在计算机视觉的最前沿

本文使用的 PyTorch 源码为 master 分支，commit id 为 a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb（https://github.com/pytorch/pytorch/tree/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb）。

背景介绍

剖析 PyTorch 显存管理机制主要是为了减少显存碎片化带来的影响。一个简单示例为：

如上图所示，假设当前想分配 800MB 显存，虽然空闲的总显存有 1000MB，但是上方图的空闲显存由地址不连续的两个 500MB 的块组成，不够分配这 800MB 显存；而下方的图中，如果两个 500MB 的空闲块地址连续，就可以通过显存碎片的整理组成一个 1000MB 的整块，足够分配 800MB。上方图的这种情况就被称为显存碎片化。

解决方法： 当有多个 Tensor 可以被释放时，可以优先释放那些在内存空间上前后有空闲内存的 Tensor。这样便于 PyTorch 整理这些空闲块组成的碎片，让三个块组成一整个更大的块。

核心问题/前提： 能否以非常小的代价（ O(1) 或 O(logn) 复杂度）拿到当前想要释放的块，以及它前后的空闲空间大小？有了这个，我们可以对 Tensor 排序，优先选择：“前后空闲块+自己大小” 最大的 Tensor 来释放。

这一前提可以转化为：找到下面两个函数（pseudo code）：

block = get_block(tensor) # 找到存储该 Tensor 的 Block
size = get_adjacent_free_size(block) # 返回该 Block 前后的空余空间，便于排序

研究 PyTorch 显存管理机制后可能能回答的问题：

为什么报错信息里提示显存够，但还是遇到了 OOM？
显存的多级分配机制是怎样的？为什么要这样设计？

源码解读

主要看 c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp 里面的 DeviceCachingAllocator 类（L403）

https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp#L403

主要的数据结构

Block：

分配 / 管理内存块的基本单位，(stream_id, size, ptr) 三元组可以特异性定位一个 Block，即 Block 维护一个 ptr 指向大小为 size 的内存块，隶属于 stream_id 的 CUDA Stream。
所有地址连续的 Block（不论是否为空闲，只要是由 Allocator::malloc 得来的）都被组织在一个双向链表里，便于在释放某一个 Block 时快速检查前后是否存在相邻碎片，若存在可以直接将这三个 Block 合成为一个。

struct Block { 
    int device; // gpu

    // Block 和被分配时调用者的 stream 是绑定的，即使释放了也无法给其他 stream 使用
    cudaStream_t stream; // allocation stream

    stream_set stream_uses; // streams on which the block was used
    size_t size; // block size in bytes
    BlockPool* pool; // owning memory pool
    void* ptr; // memory address
    bool allocated; // in-use flag
    Block* prev; // prev block if split from a larger allocation
    Block* next; // next block if split from a larger allocation
    int event_count; // number of outstanding CUDA events
};

BlockPool：

内存池，用 std::set 存储 Block 的指针，按照 (cuda_stream_id -> block size -> addr) 的优先级从小到大排序。所有保存在 BlockPool 中的 Block 都是空闲的。

struct BlockPool {
    BlockPool(
        Comparison comparator,
        bool small,
        PrivatePool* private_pool = nullptr)
        : blocks(comparator), is_small(small), owner_PrivatePool(private_pool) {}
    std::set<Block*, Comparison> blocks;
    const bool is_small;
    PrivatePool* owner_PrivatePool; // 供 CUDA Graphs 使用，此处不详讲
};

DeviceCachingAllocator 中维护两种 BlockPool (large_blocks, small_blocks)，分别存放较小的块和较大的块（为了分别加速小需求和大需求），简单地将 <= 1MB 的 Block 归类为小块，> 1MB 的为大块。

直观理解 Block、BlockPool 见下图：

BlockPool 示意图，左边两个 500MB 的块 size 相同，因此上面的比下面的地址更小

总结： Block 在 Allocator 内有两种组织方式，一种是显式地组织在 BlockPool（红黑树）中，按照大小排列；另一种是具有连续地址的 Block 隐式地组织在一个双向链表里（通过结构体内的 prev, next 指针），可以以 O(1) 时间查找前后 Block 是否空闲，便于在释放当前 Block 时合并碎片。

malloc 函数解析：返回一个可用的 Block（L466）

https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp#L466

一个区分：（出于简洁考虑，下面全文都对这两个表述进行区分，不多赘述）

size：请求分配的显存大小
alloc_size：需要 cudaMalloc 时的显存大小

一个 hard-coded： 根据 size 决定实际上的 alloc_size（get_allocation_size 函数，L1078）：https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp#L1078

为小于 1MB 的 size 分配 2MB；
为 1MB ～ 10MB 的 size 分配 20MB；
为 >= 10MB 的 size 分配 { size 向上取整至 2MB 倍数 } MB。

寻找是否有合适的 block 会有五个步骤，如果这五个步骤都没找到合适的 Block，就会报经典的 [CUDA out of memory. Tried to allocate ...] 错误（具体见下“分配失败的情况”）。

步骤一：get_free_block 函数（L1088）

https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp#L1088

TLDR：尝试在 Allocator 自己维护的池子中找一个大小适中的空闲 Block 返回。
* TLDR = Too Long; Didn't Read

用当前的 (size, stream_id) 这二元组制作 Block Key 在对应的 BlockPool 中查找；
环境变量 PYTORCH_CUDA_ALLOC_CONF 中指定了一个阈值 max_split_size_mb，有两种情况不会在此步骤分配：

需要的 size 小于阈值但查找到的 Block 的比阈值大（避免浪费block）；
两方都大于阈值但 block size 比需要的 size 大得超过了 buffer（此处是 20MB，这样最大的碎片不超过 buffer 大小）。

这里的这个阈值 max_split_size_mb 涉及一个有趣的特性，后面会讲到。
若成功分配一个 Block，则将这个 Block 从 BlockPool 中删除。后续用完释放（free）时会再 insert 进去，见free_block : L976： https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp#L976）

步骤二：trigger_free_memory_callbacks 函数（L1106）

https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp#L1106

TLDR：手动进行一波垃圾回收，回收掉没人用的 Block，再执行步骤一。

若第一步的 get_free_block 失败，则在第二步中先调用 trigger_free_memory_callbacks，再调用一次第一步的 get_free_block；
trigger_free_memory_callbacks 本质上通过注册调用了 CudaIPCCollect 函数，进而调用 CudaIPCSentDataLimbo::collect 函数（torch/csrc/CudaIPCTypes.cpp : L64）； https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/torch/csrc/CudaIPCTypes.cpp#L64
CudaIPCSentDataLimbo 类管理所有 reference 不为 0 的 Block，所以实际上 collect 函数的调用算是一种懒更新，直到无 Block 可分配的时候才调用来清理那些 reference 已经为 0 的 Block（值得一提的是，该类的析构函数会首先调用 collect 函数，见 torch/csrc/CudaIPCTypes.cpp : L58） https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/torch/csrc/CudaIPCTypes.cpp#L58；
相关源码可以看 torch/csrc/CudaIPCTypes.h & .cpp。

步骤三：alloc_block 函数（L1115）

https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp#L1115

TLDR：Allocator 在已有的 Block 中找不出可分配的了，就调用 cudaMalloc 创建新的 Block。

步骤一、二中重用 block 失败，于是用 cudaMalloc 分配内存，大小为 alloc_size；
注意有一个参数 set_fraction 会限制可分配的显存为当前剩余的显存 * fraction（若需要分配的超过这一限制则失败），但还没搞清楚哪里会指定这个（TODO）；
新分配的内存指针会被用于创建一个新 Block，新 Block 的 device 与 cuda_stream_id 与 caller 保持一致。

上面几个步骤都是试图找到一些空闲显存，下面是两个步骤是尝试进行碎片整理，凑出一个大块显存

步骤四：release_available_cached_blocks 函数（L1175）

https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp#L1175

TLDR：先在自己的池子里释放一些比较大的 Block，再用 cudaMalloc 分配看看

如果上面的 alloc_block 失败了，就会尝试先调用这一函数，找到比 size 小的 Block 中最大的，由大至小依次释放 Block，直到释放的 Block 大小总和 >= size（需要注意，这一步骤只会释放那些大小大于阈值 max_split_size_mb 的 Block，可以理解为先释放一些比较大的）；
释放 block 的函数见 release_block（L1241），主要就是 cudaFree 掉指针，再处理一些 CUDA graphs 的依赖，更新其他数据结构等等，最后把这个 Block 从 BlockPool 中移除；
当前整个 BlockPool（作为提醒，Allocator 有两个 BlockPool，这里指的是最初根据 size 指定的大 pool 或小 pool）中，可以释放的 Block 需要满足两个条件：cuda_stream_id 相同的，且大小要大于阈值 max_split_size_mb。如果将这样的 Block 全部释放的空间仍比 size 小，那么这一步就会失败。
释放掉了一批 Block 之后，再次执行步骤三中的 alloc_block 函数，创建新 Block。

步骤五：release_cached_blocks 函数（L1214）

https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp#L1214

如果释放一些 Block 还不够分配，则把整个 Allocator 中的 large / small pool 全部释放掉（同样调用 release_block：L1241： https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp#L1241），再次调用 alloc_block 函数。

malloc 分配失败的情况

https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp#L519-L560

会报经典的 CUDA out of memory. Tried to allocate ... 错误，例如：

CUDA out of memory. Tried to allocate 1.24 GiB (GPU 0; 15.78 GiB total capacity; 10.34 GiB already allocated; 435.50 MiB free; 14.21 GiB reserved in total by PyTorch)

Tried to allocate：指本次 malloc 时预计分配的 alloc_size；
total capacity：由 cudaMemGetInfo 返回的 device 显存总量；
already allocated：由统计数据记录，当前为止请求分配的 size 的总和；
free：由 cudaMemGetInfo 返回的 device 显存剩余量；
reserved：BlockPool 中所有 Block 的大小，与已经分配的 Block 大小的总和。
即 [reserved] = [already allocated] + [sum size of 2 BlockPools]

注意，reserved + free 并不等同于 total capacity，因为 reserved 只记录了通过 PyTorch 分配的显存，如果用户手动调用 cudaMalloc 或通过其他手段分配到了显存，是没法在这个报错信息中追踪到的（又因为一般 PyTorch 分配的显存占大部分，分配失败的报错信息一般也是由 PyTorch 反馈的）。

在这个例子里，device 只剩 435.5MB，不够 1.24GB，而 PyTorch 自己保留了 14.21GB（储存在 Block 里），其中分配了 10.3GB，剩 3.9GB。那为何不能从这 3.9GB 剩余当中分配 1.2GB 呢？原因肯定是碎片化了，而且是做了整理也不行的情况。

实现自动碎片整理的关键特性：split

前面提到，通过环境变量会指定一个阈值 max_split_size_mb，实际上从变量名可以看出，指定的是最大的可以被 “split” 的 Block 的大小。

在本节最开头解释过，步骤三 alloc_block 函数通过 cuda 新申请的 Block（这是 Allocator 唯一一个创建新 Block 的途径）大小是计算出的 alloc_size 而不是用户通过 malloc 请求的大小 size。因此，如果 malloc 在上述五个步骤中成功返回了一个 Block，Allocator 会通过函数 should_split (L1068) 检查：

由于过量分配内存，Block 内部产生的大小为 alloc_size - size 的碎片大小称为 remaining；
如果这个 Block 属于 small_blocks 且 remaining >= 512 Bytes；或者 remaining >= 1MB 且该 Block 大小没有超过上述的阈值，则这个 Block 需要被 split。

被 split 的操作很简单，当前的 Block 会被拆分成两个 Block，第一个大小正好为请求分配的 size，第二个则大小为 remaining，被挂到当前 Block 的 next 指针上（这一过程见源码 L570～L584：https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp#L570-L584）。这样一来，这两个 Block 的地址自然而然成为连续的了。随着程序运行，较大的 Block（只要仍小于阈值 max_split_size_mb）会不断被分成小的 Block。值得注意的是，由于新 Block 的产生途径只有一条，即通过步骤三中的 alloc_block 函数经由 cudaMalloc 申请，无法保证新 Block 与其他 Block 地址连续，因此所有被维护在双向链表内的有连续地址空间的 Block 都是由一个最初申请来的 Block 拆分而来的。

一段连续空间内部（由双向链表组织的 Block 们）如下图所示：

当 Block 被释放时，会检查其 prev、next 指针是否为空，及若非空是否正在被使用。若没有在被使用，则会使用 try_merge_blocks (L1000) 合并相邻的 Block。由于每次释放 Block 都会检查，因此不会出现两个相邻的空闲块，于是只须检查相邻的块是否空闲即可。这一检查过程见 free_block 函数（L952）。又因为只有在释放某个 Block 时才有可能使多个空闲块地址连续，所以只需要在释放 Block 时整理碎片即可。

try_merge_blocks (L1000)：https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp#L1000

free_block 函数：https://github.com/pytorch/pytorch/blob/a5b848aec10b15b1f903804308eed4140c5263cb/c10/cuda/CUDACachingAllocator.cpp#L952

关于阈值 max_split_size_mb ，直觉来说应该是大于某个阈值的 Block 比较大，适合拆分成稍小的几个 Block，但这里却设置为小于这一阈值的 Block 才进行拆分。个人理解是，PyTorch 认为，从统计上来说大部分内存申请都是小于某个阈值的，这些大小的 Block 按照常规处理，进行拆分与碎片管理；但对大于阈值的 Block 而言，PyTorch 认为这些大的 Block 申请时开销大（时间，失败风险），可以留待分配给下次较大的请求，于是不适合拆分。默认情况下阈值变量 max_split_size_mb 为 INT_MAX，即全部 Block 都可以拆分。

总结

剖析 PyTorch 显存管理机制可以帮助我们更好地寻找显存优化的思路。目前我们正在联合 Dynamic Tensor Rematerialization (DTR)（https://arxiv.org/abs/2006.09616）的作者@圆角骑士魔理沙推进 PyTorch 上 DTR 技术的工业界落地，其中一项就是解决上述文章中提到的训练过程内存碎片化问题。近期会有一篇文章介绍 DTR 落地遇到的问题 & 解决方案 & benchmark，敬请期待。

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