微RNA介导的长链非编码RNA的调控网络和功能研究

项目名称： 微RNA介导的长链非编码RNA的调控网络和功能研究

项目编号： No.31370791

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 杨建华

作者单位： 中山大学

项目金额： 80万元

中文摘要： 长链非编码RNA（lncRNA）、微RNA(miRNA)和竞争性内源RNA (ceRNA)在细胞功能和命运决定中起关键作用，并影响着肿瘤的发生发展。然而，miRNA-lncRNA和miRNA-ceRNA之间互作的潜在规律及功能还有待阐明。我们前期研究开发了starBase和ChIPBase两大功能分析平台实现对miRNA功能靶标组和lncRNA转录调控网络的研究。在此基础上，本项目拟通过整合CLIP-Seq和转录组数据，开发新的算法和平台在转录组水平系统地鉴定miRNA-lncRNA及miRNA- ceRNA互作网络；进一步结合功能基因组的数据，开发基于ceRNA调控网络预测lncRNA功能的新方法，在神经胶质瘤和结肠癌等高通量癌症基因组数据中鉴定癌症特异的lncRNA及其ceRNA 功能网络，探讨它们在肿瘤发生发展过程中的作用，拓展我们对lncRNA功能及ceRNA调控网络的认识。

中文关键词： 微RNA；非编码RNA；长链非编码RNA；ceRNA；CLIP-seq

英文摘要： Long non-coding RNAs(lncRNAs), microRNAs(miRNAs) and competing endogenous RNAs(ceRNAs) play important roles in deciding cellular function and fate, and also affect the tumorigenesis.However,the potential rules and function of miRNA-lncRNA and miRNA-ceRNA

英文关键词： microRNA；ncRNA；lncRNA；ceRNA；CLIP-seq