中国特有洞穴金线鲃属鱼类眼睛形态特征适应性演化及其与眼睛基因相关性的研究

项目名称： 中国特有洞穴金线鲃属鱼类眼睛形态特征适应性演化及其与眼睛基因相关性的研究

项目编号： No.31372191

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 孟凡伟

作者单位： 中国科学院动物研究所

项目金额： 80万元

中文摘要： 洞穴鱼类在黑暗条件下长期生存，演化出许多独特的适应性特征，如眼睛和色素缺失。金线鲃属是我国特有鱼类类群，大部分种类生活在洞穴环境中，洞穴种类金线鲃的眼睛呈现由逐渐变小直至彻底消失的表型。仅就个别基因序列的系统演化加以研究，很难对穴居动物眼睛适应性演化的分子机制做出系统的阐明。本项目选取眼睛正常的地表金线鲃和眼睛退化程度不同的洞穴金线鲃作为实验材料，比较它们眼睛的形态结构差异；选取可能在洞穴种眼睛适应性演化过程中发挥作用的转录调控基因，检测它们在不同类型金线鲃眼睛中的表达水平；结合这些转录因子DNA序列的系统演化分析结果，深入探讨相关调控基因在洞穴种眼睛适应性演化过程中可能发挥的作用和分子机制；最后，根据以上结果，选取一种洞穴金线鲃，利用新一代高通量测序技术，对其眼睛进行转录组测序，全面系统的鉴定其与地表种之间的差异表达基因，探讨洞穴种转录组的进化，加深对洞穴环境下鱼类眼睛适应性演化机制的认识。

中文关键词： 洞穴鱼；金线鲃属；眼睛；转录组测序；适应性演化

英文摘要： In adaptating to perpetual darkness, lots of adaptive features evolved in cavefish, such as losing eyes and body pigmentation. The freshwater teleost genus Sinocyclocheilus (Cypriniformes: Cyprinidae) is endemic to China. The genus contains many surface-d

英文关键词： cavefish；Sinocyclocheilus；eye；RNA-seq；adaptive evolution