人和小鼠基因内含子参与转录调控的计算研究

项目名称： 人和小鼠基因内含子参与转录调控的计算研究

项目编号： No.31360277

项目类型： 地区科学基金项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 生物科学

项目作者： 李慧敏

作者单位： 云南民族大学

项目金额： 50万元

中文摘要： 转录调控是真核基因表达调控的重要环节，关于基因转录调控的研究主要集中在转录起始位点上游区域（典型启动子区域）。近期的实验和计算分析表明，一些基因的内含子中也含有转录调控元件，然而目前对基因尤其是哺乳动物基因内含子转录调控相关功能的研究还处于探索阶段，对内含子中包含的转录调控元件、性质及其参与转录调控的方式尚不清楚。鉴于此，本项目拟以人和小鼠基因作为研究对象，分析内含子序列特征，探索内含子参与转录调控的可能性；利用统计方法识别人和小鼠基因内含子中的转录调控元件，并对元件在目标序列上的分布特征进行分析；发展计算模型预测人和小鼠基因中的转录调控模块，研究内含子与其他区域的转录协同作用，探索内含子参与转录调控的主要方式，并依此构建转录因子相互作用网络；对人和小鼠同源基因内含子中的调控元件进行比较，从转录调控角度研究内含子进化规律。本课题将从新的角度研究内含子的功能，并拓展基因转录调控研究的领域。

中文关键词： 人管家基因；小鼠核糖体蛋白基因；内含子；转录调控；协同作用

英文摘要： Transcriptional regulation is a key process in eukaryotic gene expression. Innumerable studies have focused on the canonical promoter, located upstream from the transcriptional start site. Recent laboratory and computational results suggest that there ar

英文关键词： human housekeeping genes；mouse ribosomal protein genes；introns；transcriptional regulation；synergy