尼罗罗非鱼MHC I 基因组区域标签SNPs的挖掘及其在辅助抗病育种中的应用潜力探讨

项目名称： 尼罗罗非鱼MHC I 基因组区域标签SNPs的挖掘及其在辅助抗病育种中的应用潜力探讨

项目编号： No.31402295

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 农业科学

项目作者： 高风英

作者单位： 中国水产科学研究院珠江水产研究所

项目金额： 25万元

中文摘要： 罗非鱼链球菌病已成为制约罗非鱼产业发展的关键因素，目前仍无有效的防治方法。罗非鱼抗病品种(系)培育是防病的基础。而抗病力的分子遗传研究是抗病品种培育的前提。前期研究显示，尼罗罗非鱼抗病及感病群体之间MHCIIB基因多态性有着明显的差异；且MHC I基因cDNA有丰富的多态性。本项目拟进一步对尼罗罗非鱼MHC I 基因的基因组区域进行单核苷酸多态性（SNP）分析，利用SNP位点之间的连锁不平衡（linkage disequilibrium, LD），分析可能存在的单倍型块以及单倍型；进而分析单倍型块及单倍型上的标签SNP。利用标签SNP在抗病群体和感病群体中的分布频率的差异，判断其与抗链球菌病性能之间的关系，初步筛选链球菌病抗性/敏感相关单倍型或SNP位点；并在全同胞敏感和抗病个体中进行验证；最后通过分析它们的遗传特性及其在后代中的遗传分离模式和初步的辅助选育探讨其应用潜力。

中文关键词： 尼罗罗非鱼；主要组织相容性复合体；单核苷酸多态性；标签SNP；抗病育种

英文摘要： The tilapia aquaculture industry has been severely threatened by S. agalactiae bacteria infection in recent years. It has not been found the effective prevention and treatment measures. The breeding of new stock with enhanced disease resistance is the fou

英文关键词： Nile tilapia；major histocompatibility complex (MHC)；single nucleotide polymorphism (SNPs)；tag SNP；disease resistance breeding