项目名称: PtrSND1-A2选择性剪接产物在木材发育过程中的功能解析及其产生机制的初步探讨
项目编号: No.31370593
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2013
项目学科: 农业科学
项目作者: 李全梓
作者单位: 中国林业科学研究院
项目金额: 84万元
中文摘要: 木材的次生璧是生物质能源的主要来源。SND1是控制次生璧加厚的关键基因。在杨树木质部中有四个与拟南芥的SND1同源的基因,PtrSND1-A1、PtrSND1-A2、 PtrSND1-B1和PtrSND1-B2。本申请人前期的研究发现PtrSND1-A2通过选择性剪接的方式产生一个小的蛋白PtrSND1-A2IR,但对于该基因在木材发育过程中是如何调控纤维素、半纤维素和木质素的合成还不清楚。本研究主要是在杨树木质部中特异性地过量表达该蛋白,通过观察转基因植株木质部中纤维和导管发育和分析转基因木材的化学成分含量和结构来揭示该蛋白在次生壁加厚过程中的功能。利用生物信息学分析RNA-seq和ChIP-seq 结果阐明PtrSND1-A2IR对SND1调控的基因网络的影响及作用机制,并对PtrSND1-A2IR的产生机制进行初步探讨。研究结果将为改良木材性状提供理论依据。
中文关键词: 木材形成;NAC;转录因子;可变剪接;
英文摘要: The secondary cell walls of woody are the major resources for biomass. SND1 is the key gene controlling secondary cell wall formation. In Populus trichocarpa, PtrSND1-A1, PtrSND1-A2, PtrSND1-B1 and PtrSND1-B2 are the homologs of Arabidopsis SND1. In a pre
英文关键词: Wood formation;NAC;Transcription factor;Alternative splicing;