项目名称: IRF1在诱导分化过程中全基因组水平调控机制的研究
项目编号: No.31171257
项目类型: 面上项目
立项/批准年度: 2012
项目学科: 遗传学与生物信息学、细胞生物学
项目作者: 王侃侃
作者单位: 上海交通大学
项目金额: 70万元
中文摘要: 全反式维甲酸(ATRA)诱导分化治疗急性早幼粒细胞白血病(APL)的成功,使APL成为第一种可能治愈的成人白血病,然而ATRA的应用范围较为局限。大量的研究及我们的前期工作提示,与多种白血病及实体瘤发生密切相关的干扰素调节因子1(IRF1),在ATRA高效诱导APL细胞分化中起着关键作用,通过激活其下游靶基因参与多条重要的信号通路。IRF1的重要性还体现在抗肿瘤药物干扰素的临床应用中,不仅决定其疗效,还能作为判断预后的指标。本研究拟采用高通量ChIP-Seq技术,整合分子生物学、生物信息学等方法,研究IRF1在ATRA诱导分化早期的靶基因及下游调控的功能分子网络,不仅能深入阐明IRF1在ATRA高效治疗APL中的关键作用,揭示维甲酸通路和干扰素通路的交互作用机制,同时有助于进一步了解其在其它恶性肿瘤治疗中的意义,进而探索此高效治疗成功典范的普遍价值。
中文关键词: 干扰素调节因子-1;全反式维甲酸;染色质免疫沉淀整合测序技术;转录调控;高通量技术
英文摘要:
英文关键词: IRF1;ATRA;ChIP-seq;transcription regulation;High-throughput techniques