面向蛋白质结构预测的支持向量机的研究

项目名称： 面向蛋白质结构预测的支持向量机的研究

项目编号： No.60903092

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2010

项目学科： 金属学与金属工艺

项目作者： 郭骏

作者单位： 华东师范大学

项目金额： 17万元

中文摘要： 如何获得蛋白质的结构是生物学研究的一个重要课题。目前通过实验方法确定蛋白质结构的过程仍然非常复杂，周期很长。因此，作为辅助方法的结构预测技术的研究非常活跃。尤其是最近刚刚发展起来的基于支持向量机(SVM)的蛋白质结构预测技术，已经显示了在预测准确率方面远高于以往方法的优势。本课题研究面向蛋白质二级结构和结构域预测的SVM，目标是从多个角度提升SVM技术在蛋白质结构预测中的效率性、准确性和可靠性。首先，研究蛋白质结构数据，提出能良好反映数据意义的编码方法；然后，分别研究面向多类模式识别问题的SVM和并行SVM，提出相应的算法；接下来，寻求把多类SVM和并行SVM相结合的办法，并应用于蛋白质结构预测，用大量实验来验证提出的方法的有效性；最后，开发简单易用，性能优良的预测软件。 本课题不仅能推动SVM的发展，同时也为蛋白质结构预测提出了新方法，在科学、工程、社会和经济效益上都具有及其重要的意义。

中文关键词： 多类支持向量机；并行支持向量机；蛋白质结构预测；编码方法；预处理

英文摘要：

英文关键词： multi-class SVM；parallel SVM；protein structure prediction；encoding；preprocessing