基于metagenetics技术建立快速高效的生物多样性监测法

项目名称： 基于metagenetics技术建立快速高效的生物多样性监测法

项目编号： No.31170498

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2012

项目学科： 生物科学

项目作者： Douglas Yu

作者单位： 中国科学院昆明动物研究所

项目金额： 70万元

中文摘要： 生物多样性测量在解决我国环境问题的工作中受到了越来越多的关注，如对具有丰富及特有生物多样性的地区进行调查及监测、病虫害及环境污染的监控、生态保护项目（如人工橡胶林种植）的管理与监督等。然而目前的生物多样性测量既耗时又费钱。因此，本项目拟将metagenetics与二代测序技术、生物信息学和统计学分析相结合，缩短生物多样性调查与监测的周期。我们把metagenetics技术运用到动物条形码（线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ基因-COI）的研究中，主要进行以下工作：（1）改进COI引物的通用性，增加目标类群扩增过程中的物种获得率；（2）建立一套用于metagenetics数据的生物信息学分析系统；（3）基于生物信息学分析系统的结果，建立环境监测和自然保护的数学模型；（4）并与传统方法采集的生物多样性数据进行比较。该监测法的成功建立将对自然保护、害虫诊断、污染水平检测及建立绿色经济等具有重要的意义。

中文关键词： 高通量条形码；生物多样性；生物信息学途径；数据分析；实地检验

英文摘要：

英文关键词： Metabarcoding；Biodiversity；Bioinformatic pipelines；Statistical analysis；Testing in real landscapes