Nature:新冠病毒,共发了多少篇论文?附新冠病毒传播时间轴梳理

2020 年 2 月 1 日 学术头条



2020 年 1 月 29 日,《新英格兰医学杂志》发表一篇题为 Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus–Infected Pneumonia的论文,披露了迄今为止最为详细的新冠病毒早期流行病学数据(“NEJM医学前沿”对论文做了中文全文翻译:翘首以盼的流行病学数据来了|新冠肺炎),其中最为关键的结论之一为新型肺炎“人传人” 在 2019 年 12 月早已出现,同时披露了有医务人员在 1 月初已经感染。


论文发表后引发了大量的关切。对此,中国疾控中心 1 月 31 日晨间发布说明回应称,研究为回顾性分析,所有病例在论文撰写前已向社会公布;而医务人员感染情况已经于 1 月 20 日对外公布。


据财新记者不完全统计,截至 1 月 30 日,中国学者已经在国外权威学术期刊《柳叶刀》《新英格兰医学杂志》上分别发表了 5 篇、2 篇有关新冠病毒肺炎的文章。论文涉及新冠病毒肺炎的流行病学及临床特征、早期传播作用方式、疫情的进展情况等。


2020 年 1 月 30 日,Nature 杂志发声China coronavirus: how many papers have been published?


该杂志编辑从各大学术平台上对发表关于武汉新型冠状病毒的英文论文进行统计,从1 月 10 日起到 1 月 30 日,英文论文至少有 54 篇,其中超过 30 篇文章出现在预印网站上,抢占先机快速发表。


1 月 29 日,科技部官网发布称,科技部近日下发《关于加强新型冠状病毒肺炎科技攻关项目管理有关事项的通知》,通知要求各科技攻关项目承担单位把论文“写在祖国大地上”,把论文写在抗击疫情的第一线,把研究成果应用到战胜疫情中,在疫情防控任务完成之前不应将精力放在论文发表上。未来一段时间中国科学家发表新冠病毒相关的速度可能会有所放缓!




目前的质疑焦点在于,这些研究(尤其是中国团队的研究)中的一些与公共利益高度相关的信息,是否本可以不囿于论文的发表,更及时地传达给公众。


学术头条小编整理了一些论文的内容并结合 2020 年 1 月 24 日国际顶级医学期刊The Lancet(《柳叶刀》)发表的题为 Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China(《中国武汉地区2019年新型冠状病毒感染者的临床特征》)文章中疫情初始阶段41名病例的临床资料的基础上,抽取了这些病例的时间分布信息,并与各大渠道发布的信息作比较,供读者参考。统计截止时间为 2020 年 1 月 31 日。



橙色为确诊病例及相关信息,紫色为科研及官方处理进度信息

点击查看大图


新冠病毒传播事件时间轴:


2019

12.1



已知出现的第一个未接触华南海鲜市场的病例(注:由于病毒有潜伏期,感染时间应该更早)

(出自《中国武汉地区2019年新型冠状病毒感染者的临床特征》论文及内容摘要)



出现第一例与海鲜市场相关的感染者

(出自2019年新型冠状病毒感染者的临床特征》论文及内容摘要)

2019 12.10

2019

12.31



武汉市卫健委通报:累计病例27例,9例严重;国家卫健委派专家组赴武汉指导疫情工作,副组长王广发同日抵汉;

未发现人传人及医务人员感染现象


https://m.weibo.cn/2656274875/4455515629044917



发表在《柳叶刀》上的论文的文献检索截止日期

41例病患,死亡6例;

武汉卫健委通报未发现医务人员感染及人传人证据;

专家组副组长王广发接受专访时表示:

“目前病人的病情和疫情处于可控状态,大部分患者属于轻度到中度”;

论文显示:新型冠状病毒会导致与非典相似的严重呼吸系统疾病,并伴有重症监护需求及高死亡率,并发症包括急性呼吸窘迫综合症等

2020 

1.11

2020

1.15




复旦大学姜世勃等人在Journal of Medical Virology 在线发表题为“Recentadvances in the detection of respiratory virus infection in humans”的综述文章,该综述总结了用于检测常见呼吸道病毒【例如流感病毒,人呼吸道合胞病毒(RSV),冠状病毒,人腺病毒(hAdV)和人鼻病毒(hRV)】的当前可用和新颖的诊断方法。还描述了用于同时检测多种呼吸道病毒的多重测定。预计这些数据将有助于研究人员和临床医生制定适当的诊断策略,以便及时有效地检测呼吸道病毒感染。


(https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.25674)





复旦大学医学院Hongzhou Lu等人在JMV上报道了武汉疫情。(https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.25678)


2020.1.16

2020

1.20



国家卫健委高级别专家组19日赴武汉考察,钟南山担任组长答记者问证实人传人及有医务人员感染



南开大学高山团队的本科生发表文章对冠状病毒基因组进行生物信息学分析。


2020.1.21



伦敦帝国理工学院MRC全球传染病分析中心三份关于武汉新冠肺炎疫情的建模估算报告。(https://www.imperial.ac.uk/mrc-global-infectious-disease-analysis/news--wuhan-coronavirus/)









中国科学院上海巴斯德研究所郝沛等人在SCIENCE CHINA Life Sciences(《中国科学:生命科学》英文版),在线发表了题为:“Evolutionof the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of itsspike protein for risk of human transmission”的论文,推测武汉冠状病毒的自然宿主可能与SARS一样,都是蝙蝠。

(链接:https://doi.org/10.1007/s11427-020-1637-5)


其中重要结论是:武汉新型冠状病毒虽然换掉了4个关键蛋白,但是与人ACE2的亲和力还是很强。研究人员比较了SARS的S-蛋白与新型冠状病毒的S-蛋白结构,发现虽然替换了4个关键氨基酸,但结构并没有发生变化,二者RBD结构域的3D结构几乎相同,难怪和SARS那么像。很容易让人误导为是SARS病毒。



2020

1.22



Journal of MedicalVirology 杂志上发表了北京大学、广西中医药大学、宁波大学、武汉生物工程学院等单位联合完成的论文:Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newlyidentified coronavirus may boost cross‐speciestransmission from snake to human,该研究表明,蛇是造成当前武汉新型冠状病毒2019-nCoV感染爆发的最可能的野生动物库。

(链接:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.25682)






全国除青海、西藏及有疑似病例内蒙古均出现确诊病例,湖北确诊444例;

武汉封城;


中科院武汉病毒所石正丽团队在bioRxiv在线发表题为“Discovery of a novel coronavirus associated with the recentpneumonia outbreak in humans and its potential bat origin”的研究论文,该研究对先前的结果提出了新的挑战,认为蝙蝠才是最有可能的携带2019-nCoV病毒的野生动物。

总而言之,这项研究提供了有关nCoV-2019的第一份详细报告,nCoV-2019是造成中国中部武汉市持续性急性呼吸道综合症流行的病因。在此阶段,我们对病毒知之甚少,包括基本生物学,动物来源或任何特定治疗方法。

(链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.22.914952v1)

2020.1.23



另外, JAMA发表题为“CoronavirusInfections—More Than Just the Common Cold”的观点文章,系统总结了最新的武汉肺炎的进展。

(https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2759815)



2020

1.24



中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所公布了“第一株2019-nCoV病毒毒种信息”,信息表明2019-nCoV与2003年“非典”SARS冠状病毒和“中东呼吸综合征”MERS冠状病毒一样,同属于β冠状病毒。但是通过基因序列比对,2019-nCoV与SARS-CoV相似度更高达到约80%,与MERS-CoV的相似度为40%。





此外,国际顶尖医学期刊《柳叶刀》(Lancet)在线发表有关新型冠状病毒两篇研究论文,论文第一作者之一为武汉金银潭医院副院长黄朝林,其他作者包括2019年末赶赴武汉专家组的王广发、李兴旺、蒋荣猛等人,通讯作者冯子健等人。


两篇论文分别表达武汉首批41名感染者临床特征,和遗传角度分析一家七口感染案例。最终结论表明,大部分感染者为青壮年和健康人,25-49岁感染者比例为49%;冠状病毒已经出现第四代传播,七口之家中已有六例感染;已经被2019-nCoV病毒感染的危重患者,免疫系统已经出现致命的细胞因子风暴现象。


(https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30186-0/fulltext)


(https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30185-9/fulltext)




新增病例105例




世界卫生组织(WHO)突发事件委员会经讨论,决定将此次新型冠状病毒感染的肺炎疫情确认为“国际关注的突发公共卫生事件”(PHEIC)。同时,还建议把此次肺炎临时命名为“2019-nCoV 急性呼吸道疾病”。

https://www.who.int/ihr/current/en/



全国累计确诊9692例,累计死亡213例(https://weibo.com/jiankangzhongguo?refer_flag=1001030103_&is_hot=1#_loginLayer_1580478618913)


2020

1.31


主要参考信息:

中文论文全文:NEJM医学前沿:翘首以盼的流行病学数据来了|新冠肺炎

https://mp.weixin.qq.com/s/4MrNMiGWdvEDlyKyHviDiQ

新冠肺炎“人传人”已月余 中疾控论文与武汉通告不符

http://www.caixin.com/2020-01-30/101509638.html

英文论文全文:Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus–Infected Pneumonia

https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2001316


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