建立解析非编码RNA溶液结构的新方法

项目名称： 建立解析非编码RNA溶液结构的新方法

项目编号： No.31400735

项目类型： 青年科学基金项目

立项/批准年度： 2014

项目学科： 生物科学

项目作者： 龚洲

作者单位： 中国科学院武汉物理与数学研究所

项目金额： 24万元

中文摘要： 非编码RNA是一类具有调控功能的重要信号分子，由于其柔性较大、结构多变，很难用传统的结构生物学手段解析其结构。研究方法的严重缺乏制约了我们对非编码RNA功能的认知。最近，申请人发展了一种用于蛋白质结构研究的溶液顺磁弛豫增强技术（sPRE），该方法是在传统PRE方法上的改进，其优点是不需要连接顺磁探针，操作方便且成本低廉。预实验表明，sPRE方法可用于RNA结构的解析，但需解决几个问题：（1）设计合成呈球形、与RNA无相互作用的新探针；（2）改进NMR脉冲序列和采样技术；（3）发展sPRE的理论计算和结构分析方法。本项目拟通过解决这些问题，结合我们在蛋白质和非编码RNA结构研究方面大量的工作积累，以HIV-1的TAR RNA作为模型分子，建立能够广泛应用于非编码RNA结构研究的新方法。本项目的顺利实施将给非编码RNA的结构研究提供一个极佳的手段，对于揭示非编码RNA的生物学功能有重要的意义。

中文关键词： 非编码RNA；溶液顺磁弛豫增强；动态结构；多方法整合；分子探针

英文摘要： Non-coding RNA is a kind of important signal molecules with regulation functions. It is hard to analyze the structure of non-coding RNA through traditional structural biological approach, because of their flexibility and variety of structures. The shortag

英文关键词： non-coding RNA；solvent paramagnetic relaxation enhancement；dynamic structure；integrated structural biolgy；molecular probe