DNA聚合酶的工作机理研究

项目名称： DNA聚合酶的工作机理研究

项目编号： No.11374352

项目类型： 面上项目

立项/批准年度： 2013

项目学科： 数理科学和化学

项目作者： 谢平

作者单位： 中国科学院物理研究所

项目金额： 76万元

中文摘要： DNA聚合酶是作用于核酸的分子马达，在DNA复制、修复等过程中起着关键作用。近年来，随着单分子、荧光、超分辨成像等新技术的发展，DNA聚合酶的特性被越来越多地揭示出来。但其工作的物理、化学动力学机制仍然存在很多谜。本项目主要研究不同家族DNA聚合酶（如：A家族T7聚合酶，X家族聚合酶beta、mu和lambda，Y家族聚合酶Dbh和Dpo4）工作的分子机理。研究内容包括：利用分子动力学全原子计算分析上述不同家族DNA聚合酶的构象随化学状态的变化动力学。计算和确定聚合酶与DNA相互作用势随化学状态的变化规律。在分析这些构象及作用势的变化规律的基础上，建立不同家族聚合酶沿DNA模板运动的物理和数学模型。解释关于DNA聚合酶一些至今没有解释的特性。定量比较理论所得结果与已发表的实验结果，并预言新的结果，指导进一步实验研究。

中文关键词： 工作机理；动力学特性；DNA聚合酶；RNA聚合酶；驱动蛋白

英文摘要： DNA polymerases (DNA pols) are molecular motors that interact with DNA. They play critic roles in DNA replications and DNA repairs. Recently, with the advent of new experimental methods such as single-molecule techniques, florescence, high-resolution imag

英文关键词： Molecular mechanism；dynamics；DNA polymerase；RNA polymerase；kinesin