北京线下班|科研图像处理与作图排版(2019年1月12-13)

2018 年 12 月 11 日 外泌体之家

课程介绍


第1天  科研图像处理

【主讲老师】李博士  生物成像与图像处理领域资深专家,曾任中科院某所影像平台主任。

【内容简介】准确、高效、美观的图像数据往往直接提升论文的影响因子档次。图像处理也是科研工作者犯错失误的重灾区。本部分课程主要讲解图像基础知识、软件图像处理操作。软件包括全能型图像软件Photoshop,以及国际学术界使用最广的科研图像处理软件ImageJ。课程目的是让学员做到:1-不犯错图像错误;2-提升日常图像处理效率、准确度;3-具备部分高级图像分析能力。

第2天  论文作图与排版

【主讲老师】科汇堂绘图团队共同开发课程。由具有学术背景的老师讲授。

【内容简介】高影响因子杂志对示意图、图表排版的要求极高,Nature、JACS官网有专门供下载的图表格式要求文档。但国内大部分科研工作者甚至都不曾读懂,比如字体大小pt是如何设置?线条粗细1pt是什么意思?300ppi又是什么意思?本部分课程介绍论文配图绘制、大图排版、图表美化和会议展报制作的实现,教学中强调实际操作,以保证学员在课程结束后有实际操作能力的提升。通过两天的系统学习,即可轻松实现《Nature》级的图表。


课程大纲、案例


第1天:科研图像处理

本部分课程从图像的基础知识讲起,逐渐过渡到软件操作和应用案例实现。ImageJ是国际学术界使用最广、最权威的开源图像处理软件,且不存在收费和版权问题,遗憾的是在国内不够普及。Photoshop功能强大,适用于科研工作中的各种日常场景。

1.1 科研图像基础

分辨率/图像尺寸计算、灰度/RGB/CMYK/HSB/Lab色彩模式及其应用、直方图、调色:黑场/白场/中间色调(gama值)、白平衡、图像格式:tiff/gif/jpg/png

1.2 常用成像仪器采图要点

激光共聚焦显微镜等成像设备的采图原理、及其数据处理差异、采图参数要求

1.3 图像软件

Photoshop:核心概念:图层/蒙版/曲线、调色:曲线/色阶、图像裁剪、像素/尺寸修改、自动拼接、测量、TEM照片上色、制作展示视频

ImageJ:基础操作、通道融合/拆分、图像调节深析、伪彩、去噪、图像运算、光照不均校正、加标尺批处理

1.4 案例解析:

病理切片分析、纳米球尺寸/粒径分布测量、光照不均校正/物镜污渍去除、白平衡、荧光强度定量分析、Western  blotting条带分析、细胞面积/体积测量、计数、共定位、制作展示视频

1.5 SCI杂志对图像的要求

尺寸要求、采图原则、后处理注意事项

1.6 科研图像伦理

不能有的操作、必须有的操作;提升质量的操作。


示例:共聚焦采图标准

示例:白平衡校正

示例:多通道荧光图像处理

示例:不同种类噪点及去除


示例:荧光定量


示例:病理切片分析


示例:显微镜光照不均校正


示例移除图像中的外源污渍


示例Western Blot条带分析


示例面积计算


示例:SEM照片上色


第2天:AI绘图与排版

本部分课程围绕Adobe Illustraror(AI)在科研中的应用展开,包含:示意图绘制、配色入门、Graphpad与AI联用美化图表、论文大图排版、会议展报制作等。本部分侧重操作,学员在老师的带领下练习由简单到复杂的案例。课程结束后学员有能力自己制作《Nature》级的图表。

2.1 绘图/设计基础

矢量绘图原理、常见效果及其实现、配色/字体/排版、论文配图要点及、SCI高分论文示例、两色/三色搭配、主色/辅助色/点缀色、相近色/对比色、论文配色思路

2.2 AI

基础操作、画板/图层、锚点/钢笔工具;基本形状绘制、形状变换、旋转、各种对齐操作;创造复杂图形;渐变实现3D效果、用笔刷快速绘制重复单元(细胞膜、DNA等);符合SCI论文要求的导出

2.3 配图案例

绘制基本形状/细胞器

信号通路

纳米球结构

跨软件协作:图像、图形、图表综合应用

2.4 图表优化

Graphpad/Origin图表与AI的联用、矢量图的导出和格式

2.5 排版案例

论文大图排版

学术会议展报制作


示例:基本图形的绘制

示例:细胞膜的画法


示例:示意图绘制

示例:数据图表美化


示例:多图组合排版

FAQ:


没有软件怎么办软件?

报名后我们会协助安装软件,可长期使用;


教学方式是怎样的?

三段式:讲解、跟随操作、练习;


两天课程能学到什么水平?

所有学员掌握绘制常用图像处理/示意图,足以应付日常应用场景;并具备以后自我提升的方法能力。


报名信息:


上课时间&地址:2019年1月12、13,北京市区。

报名方式:

1.点击文末“阅读全文”链接报名;

2.报名网址:http://i2j9nxzpsrul6ct3.mikecrm.com/7HveyRd

注册费用:

学员类型 注册费 备注
教职工博后 3200元/人

座次按到账顺序排列

在读学生 2900元/人

(提供正规发票。费用不包含晚餐、住宿。)


学员作品 / 往期掠影:


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